44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2034 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2034  putative transmembrane protein DUF1109  100 
 
 		 213 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2177  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5130  protein of unknown function DUF1109  60.09 
 
 		 213 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5017  hypothetical protein  53.99 
 
 		 213 aa  221  9e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2181  hypothetical protein  55.4 
 
 		 213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4687  hypothetical protein  51.64 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1032  hypothetical protein  48.83 
 
 		 213 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5143  protein of unknown function DUF1109  52.11 
 
 		 213 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0995  hypothetical protein  48.83 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3063  hypothetical protein  51.64 
 
 		 213 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5126  protein of unknown function DUF1109  41.78 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1215  protein of unknown function DUF1109  41.78 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.344789  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2589  hypothetical protein  42.25 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1521  hypothetical protein  40.98 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2193  hypothetical protein  49.31 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2033  putative transmembrane protein DUF1109  43.66 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2176  hypothetical protein  43.19 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2667  protein of unknown function DUF1109  40.38 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0953  hypothetical protein  42.6 
 
 		 226 aa  104  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0957  hypothetical protein  34.56 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0019  hypothetical protein  36.62 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0022  hypothetical protein  35.68 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909042  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4407  hypothetical protein  32.86 
 
 		 213 aa  92.4  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4102  hypothetical protein  31.75 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1059  protein of unknown function DUF1109  34.11 
 
 		 212 aa  88.2  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4274  hypothetical protein  32.72 
 
 		 210 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4812  protein of unknown function DUF1109  33.96 
 
 		 214 aa  85.1  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0063  hypothetical protein  33.49 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.495811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1069  protein of unknown function DUF1109  32.26 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1911  hypothetical protein  31.92 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1024  protein of unknown function DUF1109  31.05 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2035  hypothetical protein  36.96 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0955586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2572  protein of unknown function DUF1109  35.51 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0108126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0760  hypothetical protein  34.88 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167226  normal  0.389046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2017  protein of unknown function DUF1109  32.94 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0306  protein of unknown function DUF1109  33.63 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3554  hypothetical protein  29.65 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30328  normal  0.787659 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0818  hypothetical protein  36.92 
 
 		 128 aa  61.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2572  protein of unknown function DUF1109  33.48 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.677742  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3008  hypothetical protein  29.36 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1692  hypothetical protein  29.95 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1741  hypothetical protein  33.48 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0047  hypothetical protein  40.62 
 
 		 122 aa  52  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3134  hypothetical protein  30.73 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>