43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1911 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1911  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  407  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3554  hypothetical protein  87.26 
 
 		 212 aa  295  3e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30328  normal  0.787659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2017  protein of unknown function DUF1109  78.3 
 
 		 212 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3008  hypothetical protein  66.51 
 
 		 212 aa  249  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1741  hypothetical protein  59.43 
 
 		 214 aa  164  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3134  hypothetical protein  42.45 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0306  protein of unknown function DUF1109  43.93 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1059  protein of unknown function DUF1109  34.74 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4274  hypothetical protein  34.74 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1215  protein of unknown function DUF1109  33.33 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.344789  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1069  protein of unknown function DUF1109  34.27 
 
 		 212 aa  98.2  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0957  hypothetical protein  35.62 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0019  hypothetical protein  33.33 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0022  hypothetical protein  32.86 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909042  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5130  protein of unknown function DUF1109  28.64 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4102  hypothetical protein  30.77 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4407  hypothetical protein  33.49 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2181  hypothetical protein  30.52 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5017  hypothetical protein  31.98 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0953  hypothetical protein  33.78 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0063  hypothetical protein  31.88 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.495811 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2035  hypothetical protein  32.56 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0955586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2589  hypothetical protein  32.09 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1521  hypothetical protein  32 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1024  protein of unknown function DUF1109  32.11 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2034  putative transmembrane protein DUF1109  32.87 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2177  hypothetical protein  32.87 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0760  hypothetical protein  36.78 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167226  normal  0.389046 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4687  hypothetical protein  34.23 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2572  protein of unknown function DUF1109  42.11 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.677742  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2572  protein of unknown function DUF1109  33.02 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0108126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5126  protein of unknown function DUF1109  28.64 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2033  putative transmembrane protein DUF1109  31.46 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0995  hypothetical protein  30.88 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2176  hypothetical protein  30.99 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1032  hypothetical protein  29.49 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2667  protein of unknown function DUF1109  34.83 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4812  protein of unknown function DUF1109  27.83 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1692  hypothetical protein  31.65 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2681  hypothetical protein  39.74 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.76812 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5143  protein of unknown function DUF1109  29.44 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3063  hypothetical protein  31.11 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2193  hypothetical protein  28.95 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>