43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5126 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5126  protein of unknown function DUF1109  100 
 
 		 213 aa  410  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2033  putative transmembrane protein DUF1109  61.97 
 
 		 213 aa  223  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2176  hypothetical protein  61.97 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5017  hypothetical protein  43.19 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5130  protein of unknown function DUF1109  39.91 
 
 		 213 aa  160  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2181  hypothetical protein  42.25 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2177  hypothetical protein  41.78 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2034  putative transmembrane protein DUF1109  41.78 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1032  hypothetical protein  39.91 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0995  hypothetical protein  40.38 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1215  protein of unknown function DUF1109  35.21 
 
 		 213 aa  135  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.344789  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5143  protein of unknown function DUF1109  41.31 
 
 		 213 aa  134  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3063  hypothetical protein  42.25 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4687  hypothetical protein  40.85 
 
 		 213 aa  131  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2589  hypothetical protein  37.09 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1521  hypothetical protein  38.1 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2193  hypothetical protein  40.85 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2667  protein of unknown function DUF1109  41.78 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4102  hypothetical protein  33.8 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0019  hypothetical protein  36.49 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0022  hypothetical protein  36.02 
 
 		 211 aa  104  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909042  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0953  hypothetical protein  37.35 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4407  hypothetical protein  27.7 
 
 		 213 aa  94.7  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1059  protein of unknown function DUF1109  30.99 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1069  protein of unknown function DUF1109  29.11 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0760  hypothetical protein  35.81 
 
 		 215 aa  85.1  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167226  normal  0.389046 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0063  hypothetical protein  26.96 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.495811 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4812  protein of unknown function DUF1109  31.6 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4274  hypothetical protein  29.58 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2572  protein of unknown function DUF1109  33.8 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0108126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0818  hypothetical protein  36.29 
 
 		 128 aa  72  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1024  protein of unknown function DUF1109  25.46 
 
 		 216 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0957  hypothetical protein  26.29 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2572  protein of unknown function DUF1109  27.66 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.677742  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1911  hypothetical protein  30.56 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2017  protein of unknown function DUF1109  35.87 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0306  protein of unknown function DUF1109  34.4 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3134  hypothetical protein  28.31 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2035  hypothetical protein  32.57 
 
 		 214 aa  48.1  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0955586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1741  hypothetical protein  37.86 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2681  hypothetical protein  36.07 
 
 		 214 aa  45.1  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.76812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3008  hypothetical protein  30.62 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3554  hypothetical protein  28.22 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30328  normal  0.787659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>