28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2681 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2681  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  411  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.76812 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1059  protein of unknown function DUF1109  29.41 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1069  protein of unknown function DUF1109  36.05 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4274  hypothetical protein  34.88 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2572  protein of unknown function DUF1109  37.93 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.677742  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0063  hypothetical protein  28.04 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.495811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1911  hypothetical protein  32 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4407  hypothetical protein  25.66 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1024  protein of unknown function DUF1109  32.18 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1554  hypothetical protein  40.51 
 
 		 85 aa  54.7  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2017  protein of unknown function DUF1109  29.07 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1215  protein of unknown function DUF1109  26.06 
 
 		 213 aa  51.6  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.344789  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4102  hypothetical protein  28.7 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0953  hypothetical protein  34.44 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0957  hypothetical protein  30.95 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2572  protein of unknown function DUF1109  32.16 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0108126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2562  hypothetical protein  28.05 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2035  hypothetical protein  28.31 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0955586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5130  protein of unknown function DUF1109  25.58 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4687  hypothetical protein  29.55 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2181  hypothetical protein  27.91 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5126  protein of unknown function DUF1109  36.07 
 
 		 213 aa  45.1  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3008  hypothetical protein  26.94 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0022  hypothetical protein  31.11 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909042  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3554  hypothetical protein  28.66 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30328  normal  0.787659 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0019  hypothetical protein  26.51 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5017  hypothetical protein  31.34 
 
 		 213 aa  41.6  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4812  protein of unknown function DUF1109  39.71 
 
 		 214 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>