21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1692 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1692  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  407  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2035  hypothetical protein  34.34 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0955586  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0957  hypothetical protein  29.3 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0019  hypothetical protein  29.9 
 
 
211 aa  62  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2681  hypothetical protein  34.07 
 
 
214 aa  59.3  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.76812 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4102  hypothetical protein  32.37 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0022  hypothetical protein  28.87 
 
 
211 aa  54.7  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909042  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1911  hypothetical protein  29.44 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2177  hypothetical protein  29.95 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2034  putative transmembrane protein DUF1109  29.95 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5130  protein of unknown function DUF1109  26.94 
 
 
213 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1215  protein of unknown function DUF1109  26.61 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.344789  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0953  hypothetical protein  30.84 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1059  protein of unknown function DUF1109  28.38 
 
 
212 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3554  hypothetical protein  31.13 
 
 
212 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30328  normal  0.787659 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4687  hypothetical protein  30.8 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1024  protein of unknown function DUF1109  37.1 
 
 
216 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4274  hypothetical protein  25.58 
 
 
210 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1069  protein of unknown function DUF1109  28.05 
 
 
212 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2017  protein of unknown function DUF1109  29.68 
 
 
212 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2572  protein of unknown function DUF1109  34.38 
 
 
216 aa  42  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.677742  normal  0.232156 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>