More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4788 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4788  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
184 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4698  OmpA/MotB domain protein  89.62 
 
 
184 aa  323  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0873914  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1220  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.75 
 
 
168 aa  104  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.427658  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1695  Pal family lipoprotein  38.12 
 
 
168 aa  103  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1638  outer membrane lipoprotein Omp16 (minor outer membraneprotein omp16) (16 kDa OMP) (16.5 kDa minor OMP)  38.12 
 
 
168 aa  103  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5389  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.1 
 
 
170 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0165  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.88 
 
 
174 aa  101  8e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3400  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.24 
 
 
172 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.374002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4843  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.74 
 
 
170 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.678153  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5311  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.74 
 
 
170 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1815  OmpA/MotB  42.24 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336374  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5488  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.36 
 
 
172 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.429117  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4332  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.24 
 
 
164 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4748  OmpA/MotB  41.38 
 
 
166 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6878  Outer membrane lipoprotein omp16 precursor (peptidoglycan-associated lipoprotein)  40.52 
 
 
149 aa  98.2  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.401181  normal  0.0290754 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0783  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.01 
 
 
169 aa  97.8  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2714  OmpA/MotB  39.66 
 
 
167 aa  97.8  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.358472  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1314  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.52 
 
 
165 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3509  OmpA/MotB  39.06 
 
 
164 aa  96.3  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140214  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4144  OmpA/MotB  40.52 
 
 
165 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3622  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.38 
 
 
177 aa  95.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.595111  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3199  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.99 
 
 
177 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2626  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.02 
 
 
176 aa  91.7  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0327  OmpA/MotB  36.25 
 
 
170 aa  91.7  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3494  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.25 
 
 
177 aa  88.2  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.373664  normal  0.13836 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3080  peptidoglycan-associated lipoprotein  40 
 
 
164 aa  88.2  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.430069  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2123  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.9 
 
 
166 aa  87  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.089577  normal  0.358435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0280  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.48 
 
 
168 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0118022 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2364  OmpA/MotB  38.32 
 
 
167 aa  84.7  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.550372 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3170  OmpA/MotB  40.52 
 
 
172 aa  84  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190216  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4426  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.65 
 
 
185 aa  84.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1210  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.33 
 
 
158 aa  84  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240268  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0668  OmpA/MotB family protein  37.84 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.942269  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2321  OmpA domain-containing protein  37.84 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.149229  normal  0.659387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0563  OmpA domain-containing protein  36.94 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.570179  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0687  OmpA domain-containing protein  35.09 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.182199  normal  0.103402 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1095  OmpA/MotB  33.96 
 
 
161 aa  77  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1112  peptidoglycan-associated lipoprotein  28.57 
 
 
175 aa  74.3  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.248876  normal  0.324066 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.79 
 
 
542 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0388  OmpA/MotB  35.07 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  35.71 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  36.79 
 
 
543 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2415  OmpA/MotB domain-containing protein  32.74 
 
 
173 aa  72  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  32.46 
 
 
623 aa  71.2  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0976  OmpA/MotB  38.1 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.105437  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2305  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.03 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  35.45 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  35.45 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  35.45 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  35.45 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  35.45 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  35.45 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  35.85 
 
 
544 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  35.24 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2132  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.78 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.250962  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  35.45 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  35.45 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0918  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.08 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  36.51 
 
 
294 aa  68.2  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2081  OmpA/MotB domain-containing protein  30.81 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0638605  normal  0.21469 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 
360 aa  67.8  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0695  OmpA/MotB  35.78 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  34.55 
 
 
214 aa  67  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  36.08 
 
 
330 aa  67  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  33.61 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  33.64 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  36.63 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  33.64 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  33.61 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  35.51 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  34.58 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1698  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  33.33 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000014556  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  35.51 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  34.55 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  35.35 
 
 
263 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  34.55 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  34.58 
 
 
236 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  34.91 
 
 
642 aa  65.1  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  34.58 
 
 
247 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  34.58 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  34.55 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  35.35 
 
 
263 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 
222 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1009  OmpA family outer membrane protein  35.29 
 
 
652 aa  64.7  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2669  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 
652 aa  64.7  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.650206 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1239  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  29.09 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216334  normal  0.113587 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1803  OmpA/MotB domain protein  31.01 
 
 
195 aa  64.3  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188621  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0363  OmpA/MotB domain-containing protein  31.16 
 
 
167 aa  63.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.658698  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  32.73 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0693  hypothetical protein  33.02 
 
 
230 aa  63.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1018  OmpA/MotB  31.62 
 
 
170 aa  64.3  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  35.35 
 
 
261 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  29.91 
 
 
1026 aa  63.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  34.69 
 
 
239 aa  63.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  33.94 
 
 
221 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  31.68 
 
 
670 aa  64.3  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  32.73 
 
 
215 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>