More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4698 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4698  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
184 aa  377  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0873914  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4788  OmpA/MotB domain protein  89.62 
 
 
184 aa  325  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5389  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.97 
 
 
170 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4332  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.97 
 
 
164 aa  105  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1314  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.1 
 
 
165 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4748  OmpA/MotB  36.53 
 
 
166 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4843  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.61 
 
 
170 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.678153  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5311  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.61 
 
 
170 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6878  Outer membrane lipoprotein omp16 precursor (peptidoglycan-associated lipoprotein)  35.67 
 
 
149 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.401181  normal  0.0290754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5488  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.36 
 
 
172 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.429117  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2123  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.87 
 
 
166 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.089577  normal  0.358435 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1815  OmpA/MotB  42.24 
 
 
165 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336374  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3509  OmpA/MotB  34.91 
 
 
164 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140214  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0165  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.05 
 
 
174 aa  99  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2714  OmpA/MotB  39.66 
 
 
167 aa  98.6  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.358472  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3400  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.24 
 
 
172 aa  98.2  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.374002 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0783  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.31 
 
 
169 aa  97.8  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4144  OmpA/MotB  41.38 
 
 
165 aa  97.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3622  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.1 
 
 
177 aa  97.1  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.595111  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1220  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.97 
 
 
168 aa  96.3  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.427658  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1695  Pal family lipoprotein  43.1 
 
 
168 aa  95.5  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1638  outer membrane lipoprotein Omp16 (minor outer membraneprotein omp16) (16 kDa OMP) (16.5 kDa minor OMP)  43.1 
 
 
168 aa  95.5  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2364  OmpA/MotB  35.44 
 
 
167 aa  92  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.550372 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3199  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.57 
 
 
177 aa  91.3  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2626  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.1 
 
 
176 aa  90.1  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3080  peptidoglycan-associated lipoprotein  40 
 
 
164 aa  89  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.430069  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1210  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.76 
 
 
158 aa  88.6  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240268  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3494  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.25 
 
 
177 aa  87  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.373664  normal  0.13836 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0668  OmpA/MotB family protein  38.74 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.942269  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2321  OmpA domain-containing protein  38.74 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.149229  normal  0.659387 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3170  OmpA/MotB  43.1 
 
 
172 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190216  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0280  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.36 
 
 
168 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0118022 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0327  OmpA/MotB  35.62 
 
 
170 aa  85.9  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0687  OmpA domain-containing protein  33.53 
 
 
173 aa  85.9  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.182199  normal  0.103402 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1095  OmpA/MotB  35.22 
 
 
161 aa  85.5  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0563  OmpA domain-containing protein  37.84 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.570179  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4426  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.94 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.57 
 
 
542 aa  78.2  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  34.92 
 
 
374 aa  77.8  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 
543 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  35.09 
 
 
623 aa  76.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  38.89 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  39.62 
 
 
544 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1112  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.91 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.248876  normal  0.324066 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  37.07 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  37.07 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  37.07 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  36.59 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  37.07 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  37.07 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2415  OmpA/MotB domain-containing protein  33.13 
 
 
173 aa  74.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  37.07 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  37.07 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  37.07 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2132  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.52 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.250962  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  39.18 
 
 
320 aa  71.6  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0976  OmpA/MotB  39.05 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.105437  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 
240 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  36.45 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  35.4 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  38.14 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  30.15 
 
 
510 aa  70.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  35.45 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
1026 aa  69.3  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1698  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  35.35 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000014556  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  37 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  36.36 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  35.64 
 
 
311 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  34.55 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  34.78 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0695  OmpA/MotB  36.7 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  34.78 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  34.78 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  34.55 
 
 
209 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  34.78 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  34.78 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  33.61 
 
 
237 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  42.42 
 
 
402 aa  67.8  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  33.64 
 
 
215 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  33.64 
 
 
215 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  33.61 
 
 
237 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  33.64 
 
 
215 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0363  OmpA/MotB domain-containing protein  33.83 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.658698  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  33.91 
 
 
219 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 
642 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  33.64 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  33.91 
 
 
219 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0388  OmpA/MotB  33.81 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1018  OmpA/MotB  33.33 
 
 
170 aa  67  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  37.21 
 
 
671 aa  67.4  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2081  OmpA/MotB domain-containing protein  30.77 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0638605  normal  0.21469 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  33.91 
 
 
219 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  37.62 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  33.91 
 
 
219 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  33.91 
 
 
219 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  33.91 
 
 
219 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>