More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1672 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1672  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 364 aa  724    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1278  signal recognition particle-docking protein FtsY  70.88 
 
 		 379 aa  486  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0891  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.5 
 
 		 390 aa  472  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2843  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.01 
 
 		 382 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3520  signal recognition particle-docking protein FtsY  75.62 
 
 		 382 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4374  signal recognition particle-docking protein FtsY  75.81 
 
 		 302 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1799  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.37 
 
 		 406 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.604308  normal  0.394868 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3874  signal recognition particle-docking protein FtsY  77.27 
 
 		 305 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3222  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.61 
 
 		 350 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.2315 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0268  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.56 
 
 		 398 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0386  putative cell division protein  65.19 
 
 		 328 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.919397 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0241  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.56 
 
 		 394 aa  411  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4761  signal recognition particle-docking protein FtsY  75.49 
 
 		 373 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.235875  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6139  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.66 
 
 		 388 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2727  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.28 
 
 		 386 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.863672 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0308  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.24 
 
 		 392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2869  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.58 
 
 		 386 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2820  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.32 
 
 		 388 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0492  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.19 
 
 		 380 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2195  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.19 
 
 		 327 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2809  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.19 
 
 		 388 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0746  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.71 
 
 		 476 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0576  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.71 
 
 		 476 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3127  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.38 
 
 		 327 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0466  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.71 
 
 		 433 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0561  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.38 
 
 		 439 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0316268  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0096  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.38 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.838826  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4140  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.29 
 
 		 385 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1742 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2922  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.38 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1493  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.38 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0334  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.44 
 
 		 382 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0578  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.34 
 
 		 386 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  hitchhiker  0.00686608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0281  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.59 
 
 		 340 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3504  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.45 
 
 		 346 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132371 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2738  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.19 
 
 		 328 aa  355  5.999999999999999e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0733  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.23 
 
 		 335 aa  353  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0376  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.03 
 
 		 376 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207178  decreased coverage  0.0031492 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3616  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.06 
 
 		 461 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.582435  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3718  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.49 
 
 		 361 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.94 
 
 		 513 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  50.76 
 
 		 505 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.13 
 
 		 510 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.85 
 
 		 501 aa  286  5.999999999999999e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.13 
 
 		 514 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  45.41 
 
 		 362 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.8 
 
 		 494 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.8 
 
 		 497 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.1 
 
 		 481 aa  282  6.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0170  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.54 
 
 		 347 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.200798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.72 
 
 		 453 aa  280  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  46.57 
 
 		 495 aa  279  6e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.59 
 
 		 452 aa  278  9e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.42 
 
 		 405 aa  278  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.47 
 
 		 329 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  46.15 
 
 		 471 aa  276  5e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.82 
 
 		 432 aa  275  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01431  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.9 
 
 		 311 aa  275  8e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15526  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1055  cell division protein  46.67 
 
 		 397 aa  273  3e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.571199  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0517  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.45 
 
 		 315 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0936  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.35 
 
 		 397 aa  272  7e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  49.35 
 
 		 671 aa  269  5e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0056  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.19 
 
 		 354 aa  269  7e-71  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.377347  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.01 
 
 		 373 aa  268  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.09 
 
 		 523 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  48.09 
 
 		 553 aa  267  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  48.09 
 
 		 541 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.09 
 
 		 535 aa  266  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5337  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.8 
 
 		 515 aa  265  7e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0362  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.82 
 
 		 315 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0207  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.45 
 
 		 315 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3410  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.47 
 
 		 473 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.457129 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.19 
 
 		 326 aa  264  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.22 
 
 		 397 aa  263  3e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2659  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 389 aa  263  3e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319125  hitchhiker  0.000261917 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1928  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.51 
 
 		 296 aa  263  4e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.838308  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1633  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.18 
 
 		 296 aa  263  4e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.355687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0777  Signal recognition particle GTPase-like protein  46.28 
 
 		 305 aa  263  4e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.221787  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0697  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.84 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0640674  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0934  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.84 
 
 		 478 aa  261  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000272201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.69 
 
 		 451 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  46.27 
 
 		 563 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1481  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.52 
 
 		 477 aa  261  2e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0171168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04900  signal recognition particle receptor FtsY  47.65 
 
 		 451 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0926  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.98 
 
 		 302 aa  261  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.183665  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2442  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.77 
 
 		 310 aa  260  3e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000126668  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4175  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.04 
 
 		 475 aa  260  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0143973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  44.24 
 
 		 541 aa  260  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  45.85 
 
 		 491 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2845  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.3 
 
 		 493 aa  258  8e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.634202 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  46.11 
 
 		 510 aa  258  9e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  45.85 
 
 		 491 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.13 
 
 		 482 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4411  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.18 
 
 		 437 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  45.85 
 
 		 491 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  45.85 
 
 		 491 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3774  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.18 
 
 		 582 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00390438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.5 
 
 		 584 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  46.82 
 
 		 497 aa  257  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.56 
 
 		 643 aa  257  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  47.13 
 
 		 491 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>