More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1928 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1928  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 296 aa  596  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.838308  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1633  signal recognition particle-docking protein FtsY  89.86 
 
 		 296 aa  537  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.355687  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0386  putative cell division protein  55.17 
 
 		 328 aa  292  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.919397 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0281  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.73 
 
 		 340 aa  292  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0334  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.73 
 
 		 382 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0268  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.39 
 
 		 398 aa  288  8e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0733  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.48 
 
 		 335 aa  286  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0241  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.39 
 
 		 394 aa  286  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0376  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.02 
 
 		 376 aa  285  5e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207178  decreased coverage  0.0031492 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3718  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.71 
 
 		 361 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4140  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.05 
 
 		 385 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1742 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0308  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.04 
 
 		 392 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2738  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.69 
 
 		 328 aa  281  8.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2727  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.2 
 
 		 386 aa  278  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.863672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0578  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.38 
 
 		 386 aa  278  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  hitchhiker  0.00686608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2869  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.2 
 
 		 386 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0096  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.36 
 
 		 439 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.838826  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3127  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.36 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2922  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.36 
 
 		 439 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1493  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.36 
 
 		 439 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0466  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.15 
 
 		 433 aa  275  6e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0576  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.15 
 
 		 476 aa  275  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0746  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.15 
 
 		 476 aa  275  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0492  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.7 
 
 		 380 aa  275  8e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6139  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.7 
 
 		 388 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0561  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.15 
 
 		 439 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0316268  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2820  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.7 
 
 		 388 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3616  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.98 
 
 		 461 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.582435  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2809  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.7 
 
 		 388 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908071  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2195  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.7 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.26 
 
 		 485 aa  271  7e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.36 
 
 		 373 aa  266  4e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.34 
 
 		 453 aa  264  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.35 
 
 		 452 aa  261  8e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.68 
 
 		 432 aa  261  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  50.34 
 
 		 495 aa  260  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  50 
 
 		 471 aa  258  7e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  49.83 
 
 		 541 aa  258  9e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.99 
 
 		 481 aa  257  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3767  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.61 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000377729  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3222  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.5 
 
 		 350 aa  257  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.2315 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4374  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.68 
 
 		 302 aa  255  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.33 
 
 		 510 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.33 
 
 		 494 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1799  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.51 
 
 		 406 aa  248  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.604308  normal  0.394868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.33 
 
 		 497 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.33 
 
 		 514 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  50.18 
 
 		 362 aa  248  9e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2724  hypothetical protein  52.61 
 
 		 355 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  50.68 
 
 		 671 aa  247  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0891  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.85 
 
 		 390 aa  246  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126101  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2597  hypothetical protein  52.24 
 
 		 355 aa  246  3e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3520  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.17 
 
 		 382 aa  246  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3505  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.45 
 
 		 487 aa  246  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000471575  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0777  Signal recognition particle GTPase-like protein  49.66 
 
 		 305 aa  246  3e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.221787  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2843  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.17 
 
 		 382 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2903  cell division protein FtsY  51.5 
 
 		 410 aa  246  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297557  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1294  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.67 
 
 		 416 aa  246  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000563395  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01431  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.66 
 
 		 311 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15526  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1319  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.67 
 
 		 416 aa  246  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025253  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3874  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.34 
 
 		 305 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1055  cell division protein  47.78 
 
 		 397 aa  245  6.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.571199  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2067  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.79 
 
 		 309 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959159  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.45 
 
 		 501 aa  244  9e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  50.52 
 
 		 497 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4164  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.7 
 
 		 611 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00648424  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0171  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.7 
 
 		 621 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116132  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  50.52 
 
 		 498 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.52 
 
 		 497 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  44.26 
 
 		 408 aa  243  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.6 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  50.52 
 
 		 498 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4295  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.7 
 
 		 540 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00341336  normal  0.0288649 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  50.52 
 
 		 512 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  50.52 
 
 		 498 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  50.52 
 
 		 498 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  50.52 
 
 		 498 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4094  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.7 
 
 		 615 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000394743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.33 
 
 		 561 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.4 
 
 		 482 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  50.52 
 
 		 491 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  50.52 
 
 		 491 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0275  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.38 
 
 		 587 aa  243  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125713  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0936  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.44 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  50.52 
 
 		 491 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3972  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.35 
 
 		 562 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  50.52 
 
 		 497 aa  242  5e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.35 
 
 		 584 aa  242  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  50.17 
 
 		 511 aa  242  6e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1278  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.87 
 
 		 379 aa  242  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  50.52 
 
 		 491 aa  242  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2499  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 329 aa  241  7e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00080713  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2374  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.17 
 
 		 387 aa  242  7e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000224512  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.4 
 
 		 326 aa  241  7e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.67 
 
 		 535 aa  241  9e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  50.35 
 
 		 510 aa  241  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.34 
 
 		 513 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  49.34 
 
 		 505 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  50.52 
 
 		 563 aa  241  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3670  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.63 
 
 		 329 aa  240  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000567512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>