More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3520 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2843  signal recognition particle-docking protein FtsY  98.95 
 
 		 382 aa  746    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3520  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 382 aa  753    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1799  signal recognition particle-docking protein FtsY  77.7 
 
 		 406 aa  532  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.604308  normal  0.394868 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3874  signal recognition particle-docking protein FtsY  89.33 
 
 		 305 aa  501  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4761  signal recognition particle-docking protein FtsY  74.54 
 
 		 373 aa  468  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.235875  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4374  signal recognition particle-docking protein FtsY  81.82 
 
 		 302 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1278  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.58 
 
 		 379 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1672  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.44 
 
 		 364 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0891  signal recognition particle-docking protein FtsY  77.6 
 
 		 390 aa  448  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3222  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.1 
 
 		 350 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.2315 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0386  putative cell division protein  68.31 
 
 		 328 aa  435  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.919397 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6139  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.85 
 
 		 388 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0241  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.76 
 
 		 394 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0268  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.3 
 
 		 398 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0492  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.68 
 
 		 380 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4140  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.53 
 
 		 385 aa  421  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1742 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2727  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.87 
 
 		 386 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.863672 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0334  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.46 
 
 		 382 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2820  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.78 
 
 		 388 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0308  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.18 
 
 		 392 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2869  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.61 
 
 		 386 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0466  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.84 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0576  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.69 
 
 		 476 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3127  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.35 
 
 		 327 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0746  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.69 
 
 		 476 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0578  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.07 
 
 		 386 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  hitchhiker  0.00686608 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2809  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.86 
 
 		 388 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908071  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0096  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.35 
 
 		 439 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.838826  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1493  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.35 
 
 		 439 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2922  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.35 
 
 		 439 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0281  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.7 
 
 		 340 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2195  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.86 
 
 		 327 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0561  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.69 
 
 		 439 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0316268  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3504  signal recognition particle-docking protein FtsY  72.33 
 
 		 346 aa  398  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132371 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0733  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.17 
 
 		 335 aa  347  1e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3616  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.47 
 
 		 461 aa  348  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.582435  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0376  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.94 
 
 		 376 aa  345  5e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207178  decreased coverage  0.0031492 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2738  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.96 
 
 		 328 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3718  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.31 
 
 		 361 aa  339  4e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.2 
 
 		 510 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  51.79 
 
 		 505 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.11 
 
 		 494 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.11 
 
 		 497 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.64 
 
 		 514 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.97 
 
 		 513 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.77 
 
 		 452 aa  297  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.85 
 
 		 373 aa  294  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.77 
 
 		 481 aa  293  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.99 
 
 		 432 aa  293  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.22 
 
 		 501 aa  293  5e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.39 
 
 		 451 aa  292  8e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  48.74 
 
 		 471 aa  292  8e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  48.74 
 
 		 495 aa  291  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.56 
 
 		 329 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.15 
 
 		 453 aa  287  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0170  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.43 
 
 		 347 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.200798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  50.16 
 
 		 362 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1633  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.18 
 
 		 296 aa  282  7.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.355687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04900  signal recognition particle receptor FtsY  42.42 
 
 		 451 aa  282  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01431  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.8 
 
 		 311 aa  281  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15526  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  47.99 
 
 		 491 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0468  signal recognition particle receptor FtsY  51.99 
 
 		 447 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  47.99 
 
 		 491 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5337  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.94 
 
 		 515 aa  278  9e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  47.4 
 
 		 491 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  48.41 
 
 		 563 aa  278  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  50.67 
 
 		 671 aa  277  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  48.09 
 
 		 491 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  48.58 
 
 		 541 aa  277  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  49.67 
 
 		 553 aa  276  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1928  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.17 
 
 		 296 aa  277  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.838308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0926  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.66 
 
 		 302 aa  277  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.183665  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  47.68 
 
 		 491 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.73 
 
 		 540 aa  276  5e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.58 
 
 		 523 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.41 
 
 		 535 aa  276  6e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1170  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.83 
 
 		 301 aa  276  6e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.102852  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3774  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.41 
 
 		 582 aa  275  7e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00390438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4175  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.16 
 
 		 475 aa  275  8e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0143973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.04 
 
 		 482 aa  275  9e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.28 
 
 		 397 aa  275  9e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  48.73 
 
 		 510 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0936  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.1 
 
 		 397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0934  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.84 
 
 		 478 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000272201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1055  cell division protein  46.1 
 
 		 397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.571199  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  46.75 
 
 		 498 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  48.34 
 
 		 497 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.41 
 
 		 584 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3972  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.09 
 
 		 562 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  46.75 
 
 		 498 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  48.34 
 
 		 498 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  46.6 
 
 		 512 aa  273  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  46.75 
 
 		 498 aa  273  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.37 
 
 		 375 aa  273  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  48.34 
 
 		 498 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.36 
 
 		 405 aa  273  5.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.73 
 
 		 491 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  48.34 
 
 		 497 aa  272  8.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  47.68 
 
 		 511 aa  272  9e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.01 
 
 		 497 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>