More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1278 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1278  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 379 aa  751    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0891  signal recognition particle-docking protein FtsY  78.15 
 
 		 390 aa  551  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1672  signal recognition particle-docking protein FtsY  71.91 
 
 		 364 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1799  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.24 
 
 		 406 aa  450  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.604308  normal  0.394868 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2843  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.43 
 
 		 382 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3222  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.32 
 
 		 350 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.2315 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3874  signal recognition particle-docking protein FtsY  78.71 
 
 		 305 aa  444  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3520  signal recognition particle-docking protein FtsY  75.46 
 
 		 382 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4374  signal recognition particle-docking protein FtsY  76.05 
 
 		 302 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4761  signal recognition particle-docking protein FtsY  77.02 
 
 		 373 aa  425  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.235875  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2820  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.72 
 
 		 388 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6139  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.72 
 
 		 388 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0492  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.61 
 
 		 380 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0466  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.79 
 
 		 433 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2727  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.75 
 
 		 386 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.863672 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2869  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.5 
 
 		 386 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0386  putative cell division protein  64.78 
 
 		 328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.919397 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0308  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.01 
 
 		 392 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0268  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.47 
 
 		 398 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0241  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.15 
 
 		 394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2809  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.22 
 
 		 388 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908071  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4140  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.68 
 
 		 385 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1742 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2195  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.59 
 
 		 327 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0578  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.14 
 
 		 386 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  hitchhiker  0.00686608 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3127  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.61 
 
 		 327 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0334  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.81 
 
 		 382 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0746  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.94 
 
 		 476 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3504  signal recognition particle-docking protein FtsY  71.02 
 
 		 346 aa  399  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132371 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2922  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.61 
 
 		 439 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0576  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.94 
 
 		 476 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0561  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.94 
 
 		 439 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0316268  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0096  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.61 
 
 		 439 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.838826  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1493  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.61 
 
 		 439 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0281  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.26 
 
 		 340 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2738  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.13 
 
 		 328 aa  348  1e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0733  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.95 
 
 		 335 aa  340  4e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3718  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.91 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0376  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.5 
 
 		 376 aa  323  2e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207178  decreased coverage  0.0031492 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3616  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.13 
 
 		 461 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.582435  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  50.46 
 
 		 505 aa  295  7e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.11 
 
 		 494 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.12 
 
 		 513 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.48 
 
 		 510 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.8 
 
 		 514 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.78 
 
 		 497 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.06 
 
 		 501 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.43 
 
 		 481 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0170  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.77 
 
 		 347 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.200798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  47.98 
 
 		 495 aa  279  5e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  47.98 
 
 		 471 aa  279  6e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  41.97 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.47 
 
 		 432 aa  277  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.42 
 
 		 329 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.78 
 
 		 373 aa  275  7e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.46 
 
 		 451 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.73 
 
 		 535 aa  274  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.48 
 
 		 452 aa  272  6e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.29 
 
 		 523 aa  271  9e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  47.78 
 
 		 553 aa  271  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.98 
 
 		 397 aa  271  1e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  47.78 
 
 		 541 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0934  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.62 
 
 		 478 aa  269  5e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000272201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.19 
 
 		 453 aa  269  5e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4175  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.63 
 
 		 475 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0143973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04900  signal recognition particle receptor FtsY  49.37 
 
 		 451 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  47.15 
 
 		 491 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1481  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.87 
 
 		 477 aa  266  4e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0171168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5337  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.8 
 
 		 515 aa  265  7e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0468  signal recognition particle receptor FtsY  49.2 
 
 		 447 aa  265  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  44.27 
 
 		 541 aa  265  8.999999999999999e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.95 
 
 		 405 aa  265  8.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  47.15 
 
 		 491 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  47.15 
 
 		 491 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  47.15 
 
 		 491 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.64 
 
 		 485 aa  265  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1633  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.2 
 
 		 296 aa  264  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.355687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.27 
 
 		 326 aa  264  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.73 
 
 		 375 aa  263  4e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1928  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.87 
 
 		 296 aa  263  4.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.838308  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2374  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.13 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000224512  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  46.84 
 
 		 491 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  45.89 
 
 		 511 aa  261  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  46.37 
 
 		 563 aa  261  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1055  cell division protein  43.02 
 
 		 397 aa  261  2e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.571199  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  46.2 
 
 		 498 aa  260  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  46.2 
 
 		 498 aa  260  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  46.2 
 
 		 498 aa  260  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.2 
 
 		 497 aa  260  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  46.2 
 
 		 512 aa  260  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  46.2 
 
 		 497 aa  260  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  46.2 
 
 		 498 aa  260  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  46.2 
 
 		 498 aa  260  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  46.2 
 
 		 497 aa  260  4e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0936  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.25 
 
 		 397 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01431  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.06 
 
 		 311 aa  259  7e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15526  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2659  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.02 
 
 		 389 aa  258  8e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319125  hitchhiker  0.000261917 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3505  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.74 
 
 		 487 aa  257  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000471575  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0056  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.04 
 
 		 354 aa  258  2e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.377347  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.06 
 
 		 482 aa  258  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00280  signal recognition particle GTPase  46.5 
 
 		 408 aa  258  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>