More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2195 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2820  signal recognition particle-docking protein FtsY  99.69 
 
 
388 aa  653    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632562  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6139  signal recognition particle-docking protein FtsY  98.47 
 
 
388 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2195  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 
327 aa  653    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2809  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 
388 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908071  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2727  signal recognition particle-docking protein FtsY  95.71 
 
 
386 aa  627  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.863672 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0492  signal recognition particle-docking protein FtsY  96.02 
 
 
380 aa  625  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2869  signal recognition particle-docking protein FtsY  95.4 
 
 
386 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0576  signal recognition particle-docking protein FtsY  90.83 
 
 
476 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3127  signal recognition particle-docking protein FtsY  90.52 
 
 
327 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0746  signal recognition particle-docking protein FtsY  90.83 
 
 
476 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1493  signal recognition particle-docking protein FtsY  90.52 
 
 
439 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0466  signal recognition particle-docking protein FtsY  90.83 
 
 
433 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0561  signal recognition particle-docking protein FtsY  90.52 
 
 
439 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0316268  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0096  signal recognition particle-docking protein FtsY  90.52 
 
 
439 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.838826  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2922  signal recognition particle-docking protein FtsY  90.52 
 
 
439 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0578  signal recognition particle-docking protein FtsY  90.1 
 
 
386 aa  568  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  hitchhiker  0.00686608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4140  signal recognition particle-docking protein FtsY  90.71 
 
 
385 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.1742 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0308  signal recognition particle-docking protein FtsY  85.17 
 
 
392 aa  542  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441566  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0281  signal recognition particle-docking protein FtsY  77.14 
 
 
340 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244047  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0386  putative cell division protein  77.81 
 
 
328 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.919397 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0268  signal recognition particle-docking protein FtsY  76.85 
 
 
398 aa  484  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0334  signal recognition particle-docking protein FtsY  78.88 
 
 
382 aa  484  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0241  signal recognition particle-docking protein FtsY  75.39 
 
 
394 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0733  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.52 
 
 
335 aa  397  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4374  signal recognition particle-docking protein FtsY  69.46 
 
 
302 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1799  signal recognition particle-docking protein FtsY  69.08 
 
 
406 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.604308  normal  0.394868 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2738  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.94 
 
 
328 aa  382  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1278  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.59 
 
 
379 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3520  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.86 
 
 
382 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0376  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.67 
 
 
376 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207178  decreased coverage  0.0031492 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2843  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.86 
 
 
382 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3874  signal recognition particle-docking protein FtsY  69.02 
 
 
305 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3616  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.77 
 
 
461 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.582435  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3222  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.78 
 
 
350 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.2315 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3718  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.97 
 
 
361 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0891  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.4 
 
 
390 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126101  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4761  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.12 
 
 
373 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.235875  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1672  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.19 
 
 
364 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3504  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.44 
 
 
346 aa  353  2e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132371 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.84 
 
 
501 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.62 
 
 
481 aa  315  9.999999999999999e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  51.79 
 
 
471 aa  312  5.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  51.79 
 
 
495 aa  311  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.74 
 
 
405 aa  311  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  53.09 
 
 
362 aa  310  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  53.97 
 
 
505 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.93 
 
 
513 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.47 
 
 
432 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.25 
 
 
510 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.14 
 
 
452 aa  305  8.000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.43 
 
 
494 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.43 
 
 
497 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.28 
 
 
514 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.33 
 
 
373 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.44 
 
 
535 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0934  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.81 
 
 
478 aa  300  3e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000272201  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.87 
 
 
485 aa  300  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  52.77 
 
 
553 aa  300  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  52.77 
 
 
541 aa  299  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.77 
 
 
523 aa  299  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.7 
 
 
482 aa  298  6e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0170  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.2 
 
 
347 aa  298  6e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.200798  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3774  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.22 
 
 
582 aa  295  7e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00390438  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  51.71 
 
 
510 aa  295  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  49.69 
 
 
491 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.67 
 
 
329 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.22 
 
 
584 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3972  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.58 
 
 
562 aa  293  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00124798  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  49.39 
 
 
491 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3505  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.93 
 
 
487 aa  293  3e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000471575  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1481  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.84 
 
 
477 aa  293  3e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0171168  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4175  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.59 
 
 
475 aa  292  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0143973  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.83 
 
 
453 aa  292  6e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4295  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.27 
 
 
540 aa  292  6e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00341336  normal  0.0288649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.15 
 
 
491 aa  291  9e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  49.39 
 
 
491 aa  291  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0171  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.11 
 
 
621 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116132  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4164  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.11 
 
 
611 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00648424  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  50.81 
 
 
491 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00280  signal recognition particle GTPase  50 
 
 
408 aa  291  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.67 
 
 
326 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0936  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.84 
 
 
397 aa  290  2e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.83 
 
 
397 aa  290  2e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4094  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.11 
 
 
615 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000394743  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  50.63 
 
 
563 aa  290  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.31 
 
 
540 aa  290  3e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01431  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.33 
 
 
311 aa  289  4e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15526  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  49.53 
 
 
511 aa  289  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1055  cell division protein  48.84 
 
 
397 aa  288  6e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.571199  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0216  cell division protein  51.11 
 
 
324 aa  289  6e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.345429  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  50.81 
 
 
498 aa  288  7e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  50.81 
 
 
498 aa  288  7e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  50.65 
 
 
512 aa  288  7e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  49.08 
 
 
491 aa  288  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  50.81 
 
 
498 aa  288  8e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.28 
 
 
451 aa  288  8e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  50.81 
 
 
498 aa  288  8e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  50.81 
 
 
498 aa  288  8e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.81 
 
 
497 aa  288  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  50.49 
 
 
497 aa  287  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>