More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0241 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0268  signal recognition particle-docking protein FtsY  92.21 
 
 		 398 aa  644    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0241  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 394 aa  783    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0386  putative cell division protein  94.21 
 
 		 328 aa  622  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.919397 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0334  signal recognition particle-docking protein FtsY  75.13 
 
 		 382 aa  555  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0281  signal recognition particle-docking protein FtsY  84.66 
 
 		 340 aa  537  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6139  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.58 
 
 		 388 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0492  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.34 
 
 		 380 aa  497  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2820  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.5 
 
 		 388 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0578  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.5 
 
 		 386 aa  490  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  hitchhiker  0.00686608 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0466  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.16 
 
 		 433 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4140  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.75 
 
 		 385 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1742 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2809  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.99 
 
 		 388 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908071  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0308  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.59 
 
 		 392 aa  488  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0561  signal recognition particle-docking protein FtsY  76.85 
 
 		 439 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0316268  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2727  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.9 
 
 		 386 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.863672 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2195  signal recognition particle-docking protein FtsY  75.39 
 
 		 327 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2869  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.39 
 
 		 386 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3127  signal recognition particle-docking protein FtsY  76.53 
 
 		 327 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0746  signal recognition particle-docking protein FtsY  76.53 
 
 		 476 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0576  signal recognition particle-docking protein FtsY  76.53 
 
 		 476 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2922  signal recognition particle-docking protein FtsY  76.53 
 
 		 439 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0096  signal recognition particle-docking protein FtsY  76.53 
 
 		 439 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.838826  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1493  signal recognition particle-docking protein FtsY  76.53 
 
 		 439 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4374  signal recognition particle-docking protein FtsY  69.13 
 
 		 302 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3520  signal recognition particle-docking protein FtsY  69.8 
 
 		 382 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3616  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.77 
 
 		 461 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.582435  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2843  signal recognition particle-docking protein FtsY  69.8 
 
 		 382 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0733  signal recognition particle-docking protein FtsY  60 
 
 		 335 aa  386  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1799  signal recognition particle-docking protein FtsY  69.13 
 
 		 406 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.604308  normal  0.394868 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2738  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.47 
 
 		 328 aa  382  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1672  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.78 
 
 		 364 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1278  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.4 
 
 		 379 aa  381  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3874  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.22 
 
 		 305 aa  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3718  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.09 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3222  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.8 
 
 		 350 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.2315 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4761  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.79 
 
 		 373 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.235875  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0376  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.93 
 
 		 376 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207178  decreased coverage  0.0031492 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0891  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.83 
 
 		 390 aa  371  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3504  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.62 
 
 		 346 aa  352  7e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132371 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.11 
 
 		 497 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.07 
 
 		 494 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.68 
 
 		 510 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.97 
 
 		 452 aa  323  3e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.75 
 
 		 481 aa  322  8e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  53.02 
 
 		 505 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.79 
 
 		 501 aa  319  7e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.64 
 
 		 513 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.93 
 
 		 373 aa  317  2e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  50.99 
 
 		 495 aa  316  4e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  49.69 
 
 		 471 aa  316  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.98 
 
 		 514 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.72 
 
 		 405 aa  314  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  53.62 
 
 		 362 aa  313  4.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.59 
 
 		 453 aa  309  5e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.66 
 
 		 432 aa  309  6.999999999999999e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.67 
 
 		 485 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4175  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.92 
 
 		 475 aa  305  7e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0143973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1544  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.33 
 
 		 391 aa  305  8.000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0170  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.31 
 
 		 347 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.200798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.48 
 
 		 535 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1055  cell division protein  48.42 
 
 		 397 aa  300  4e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.571199  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.66 
 
 		 523 aa  300  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  51.66 
 
 		 541 aa  300  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0936  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.1 
 
 		 397 aa  299  5e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  51.66 
 
 		 553 aa  299  5e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.94 
 
 		 375 aa  299  5e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  49.37 
 
 		 491 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.11 
 
 		 329 aa  299  7e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  49.37 
 
 		 491 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.98 
 
 		 482 aa  298  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.86 
 
 		 397 aa  298  1e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  49.37 
 
 		 491 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  50 
 
 		 563 aa  297  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0934  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.31 
 
 		 478 aa  297  2e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000272201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.28 
 
 		 451 aa  297  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  49.03 
 
 		 541 aa  297  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.99 
 
 		 561 aa  296  5e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  50.66 
 
 		 491 aa  295  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  41.49 
 
 		 512 aa  295  9e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  49.06 
 
 		 491 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5337  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.79 
 
 		 515 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.16 
 
 		 540 aa  294  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3505  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.82 
 
 		 487 aa  294  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000471575  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04900  signal recognition particle receptor FtsY  42.92 
 
 		 451 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653255  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  50.66 
 
 		 498 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  50.66 
 
 		 498 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01431  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.35 
 
 		 311 aa  293  3e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15526  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0056  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.9 
 
 		 354 aa  293  3e-78  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.377347  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  50.33 
 
 		 497 aa  293  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  50.66 
 
 		 498 aa  293  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  50.66 
 
 		 497 aa  293  4e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  50.66 
 
 		 498 aa  293  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  51.64 
 
 		 510 aa  293  5e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3774  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.97 
 
 		 582 aa  293  5e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00390438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3972  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.64 
 
 		 562 aa  292  7e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  49.67 
 
 		 511 aa  292  9e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1481  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.7 
 
 		 477 aa  291  2e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0171168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2659  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.96 
 
 		 389 aa  291  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319125  hitchhiker  0.000261917 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0414  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.64 
 
 		 447 aa  290  3e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.49 
 
 		 584 aa  290  3e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>