199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3477 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3477  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 161 aa  318  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.474814  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  41.83 
 
 		 151 aa  97.8  5e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2111  Endoribonuclease L-PSP  39.33 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  38.46 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  39.86 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  39.86 
 
 		 155 aa  89  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 152 aa  88.2  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  38.56 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  36.73 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  35.03 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0250  endoribonuclease L-PSP  36.73 
 
 		 152 aa  84.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  40.38 
 
 		 407 aa  84.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  38.78 
 
 		 153 aa  84  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0814  hypothetical protein  36.54 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.565462  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  36.05 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2450  peptidase C26  39.07 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1027  Endoribonuclease L-PSP  32.89 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190417  normal  0.406014 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  37.75 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  37.97 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  36.24 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0894  hypothetical protein  35.57 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  36.24 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2553  endoribonuclease L-PSP  35.57 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  39.87 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  36.91 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  38.31 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  38.31 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  36.6 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  34.21 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  34.9 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  35.76 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  33.11 
 
 		 153 aa  77  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  33.77 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  36.42 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0841  endoribonuclease L-PSP  38 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0402  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666223 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  36.05 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1232  Endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1477  endoribonuclease L-PSP  32.9 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  39.1 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1960  hypothetical protein  36.43 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  32.89 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1749  endoribonuclease L-PSP  35.62 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.470188  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  28.93 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  32.19 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  32.67 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  32.67 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  32.67 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  32.67 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  33.55 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  33.11 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  32.67 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  34.42 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  33.11 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  32.24 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  35.76 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1801  hypothetical protein  35.88 
 
 		 168 aa  70.5  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0113627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  33.99 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7001  Endoribonuclease L-PSP  32.67 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  32.47 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  33.11 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  36.77 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5760  Endoribonuclease L-PSP  34.44 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.332069  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5081  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0960  hypothetical protein  37.42 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.304597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  32.67 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0668  endoribonuclease L-PSP  28.67 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  33.77 
 
 		 156 aa  67  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  34.78 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25430  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  33.11 
 
 		 157 aa  67  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  34.78 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 155 aa  67  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  40.26 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  30 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1636  endoribonuclease L-PSP  33.1 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36190  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  37.93 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  31.17 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2784  endoribonuclease L-PSP  38.33 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  30.41 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  30.14 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1613  endoribonuclease L-PSP  33.1 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1999  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  30.41 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  30.41 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>