More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0057 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3319  threonine dehydratase  88.29 
 
 		 410 aa  661    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.813213  normal  0.377065 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0057  threonine dehydratase  100 
 
 		 410 aa  805    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.835911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  66.34 
 
 		 411 aa  486  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  62.68 
 
 		 410 aa  464  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  62.93 
 
 		 410 aa  459  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  62.68 
 
 		 415 aa  454  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  48.62 
 
 		 405 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  43.03 
 
 		 403 aa  342  8e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  48.08 
 
 		 402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  44.42 
 
 		 403 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  42.36 
 
 		 402 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  49.26 
 
 		 406 aa  317  3e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  45.98 
 
 		 415 aa  317  3e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  45.98 
 
 		 401 aa  316  5e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  45.98 
 
 		 401 aa  316  5e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  45.36 
 
 		 403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  42.86 
 
 		 403 aa  311  2e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  47.86 
 
 		 402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  43.11 
 
 		 402 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  42.54 
 
 		 403 aa  306  6e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  42.22 
 
 		 402 aa  306  6e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  40.66 
 
 		 400 aa  305  8.000000000000001e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  40 
 
 		 404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  40.15 
 
 		 403 aa  301  9e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  38 
 
 		 403 aa  301  2e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  44.67 
 
 		 403 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  45.11 
 
 		 403 aa  299  5e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  45.16 
 
 		 412 aa  299  6e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  44.42 
 
 		 403 aa  299  6e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  38.44 
 
 		 403 aa  297  2e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  47.13 
 
 		 404 aa  298  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  47.87 
 
 		 404 aa  296  6e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  46.78 
 
 		 443 aa  294  2e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  37.94 
 
 		 403 aa  294  2e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1619  threonine dehydratase  46.73 
 
 		 400 aa  294  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.458983  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  43.92 
 
 		 412 aa  293  5e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  37.69 
 
 		 403 aa  292  6e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  45.15 
 
 		 412 aa  292  8e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  43.18 
 
 		 403 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  47.63 
 
 		 402 aa  291  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  45.61 
 
 		 402 aa  291  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4230  threonine dehydratase  47.38 
 
 		 412 aa  290  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0941557  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  43.61 
 
 		 403 aa  290  4e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  44.36 
 
 		 403 aa  289  6e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  40.15 
 
 		 401 aa  288  8e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  44.89 
 
 		 402 aa  288  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  37.75 
 
 		 402 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  37.5 
 
 		 402 aa  287  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  40.2 
 
 		 401 aa  286  4e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0922  threonine dehydratase  49 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411143  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  46.29 
 
 		 411 aa  282  7.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  43.08 
 
 		 408 aa  281  1e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  44.2 
 
 		 416 aa  280  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  45.48 
 
 		 401 aa  280  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  45.58 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  46.33 
 
 		 407 aa  277  3e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  40.71 
 
 		 402 aa  276  5e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  40.15 
 
 		 537 aa  276  6e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  39.59 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  43.77 
 
 		 406 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  42.46 
 
 		 418 aa  273  6e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  44.86 
 
 		 402 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  42.36 
 
 		 403 aa  272  8.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08200  L-threonine ammonia-lyase  43.5 
 
 		 408 aa  271  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0196535 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1075  threonine dehydratase  44.22 
 
 		 405 aa  271  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0961  threonine dehydratase  42.64 
 
 		 404 aa  271  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  47 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4419  threonine dehydratase  45.18 
 
 		 403 aa  265  8e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  41.04 
 
 		 400 aa  265  8.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  42.08 
 
 		 403 aa  265  1e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  41.9 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  43.35 
 
 		 412 aa  262  8e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  39.14 
 
 		 403 aa  261  1e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  39 
 
 		 403 aa  261  1e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3984  threonine dehydratase  44.5 
 
 		 412 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  42.25 
 
 		 413 aa  261  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  43.67 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  45.53 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  44.19 
 
 		 402 aa  260  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1842  threonine dehydratase  40.95 
 
 		 416 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  41.73 
 
 		 408 aa  259  5.0000000000000005e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19518  predicted protein  39.9 
 
 		 479 aa  256  4e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  41.65 
 
 		 399 aa  255  9e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1939  threonine dehydratase  40.49 
 
 		 410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  36.65 
 
 		 408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3029  threonine dehydratase  41 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0116526 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1467  threonine dehydratase  44.09 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.912465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  45 
 
 		 414 aa  251  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  44.25 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  41.61 
 
 		 409 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1100  threonine dehydratase  40.99 
 
 		 421 aa  249  9e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0909  threonine dehydratase  41.79 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4359  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  46.37 
 
 		 321 aa  248  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0664  threonine dehydratase  45.41 
 
 		 413 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0080  threonine dehydratase  43.36 
 
 		 399 aa  246  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0099  threonine dehydratase  43.36 
 
 		 399 aa  246  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1894  threonine dehydratase  41.6 
 
 		 408 aa  246  4.9999999999999997e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.878805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  34.76 
 
 		 406 aa  246  8e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  40.5 
 
 		 411 aa  244  9.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1888  threonine dehydratase  44.7 
 
 		 413 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.795284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>