More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1894 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1894  threonine dehydratase  100 
 
 		 408 aa  823    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.878805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08200  L-threonine ammonia-lyase  70.02 
 
 		 408 aa  522  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0196535 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  59.85 
 
 		 402 aa  438  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  59.09 
 
 		 402 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  55.42 
 
 		 402 aa  421  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  57.43 
 
 		 404 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1075  threonine dehydratase  57.69 
 
 		 405 aa  402  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0939  threonine dehydratase  63.85 
 
 		 399 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  57.73 
 
 		 406 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  58.87 
 
 		 412 aa  386  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  54.34 
 
 		 412 aa  385  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  55.67 
 
 		 401 aa  383  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  53.09 
 
 		 412 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0922  threonine dehydratase  56.7 
 
 		 403 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411143  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  55.24 
 
 		 404 aa  373  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1619  threonine dehydratase  56.2 
 
 		 400 aa  365  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.458983  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4419  threonine dehydratase  56.01 
 
 		 403 aa  362  8e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1888  threonine dehydratase  57.46 
 
 		 413 aa  358  9e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.795284 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  51.34 
 
 		 443 aa  353  4e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0664  threonine dehydratase  57.47 
 
 		 413 aa  352  5e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  54.06 
 
 		 411 aa  352  8.999999999999999e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  46.23 
 
 		 405 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  41.81 
 
 		 403 aa  323  4e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  42.93 
 
 		 403 aa  310  4e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  45.31 
 
 		 403 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  43.96 
 
 		 403 aa  297  3e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  44.78 
 
 		 402 aa  296  4e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  41.01 
 
 		 402 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  45.84 
 
 		 402 aa  290  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  44.78 
 
 		 402 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  41.21 
 
 		 403 aa  286  4e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  46.41 
 
 		 402 aa  286  5e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  39.74 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  39.9 
 
 		 403 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  45.29 
 
 		 415 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  41.52 
 
 		 402 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  45.05 
 
 		 403 aa  282  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  45.05 
 
 		 403 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  44.27 
 
 		 402 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  45.14 
 
 		 403 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  42.6 
 
 		 403 aa  279  7e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  39.95 
 
 		 400 aa  279  8e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  39.31 
 
 		 403 aa  276  6e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  46.04 
 
 		 410 aa  273  3e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  38.79 
 
 		 403 aa  272  8.000000000000001e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  38.52 
 
 		 403 aa  271  2e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  43.62 
 
 		 399 aa  270  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  38.46 
 
 		 402 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4230  threonine dehydratase  46.23 
 
 		 412 aa  269  5.9999999999999995e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0941557  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  41.25 
 
 		 403 aa  269  8e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  41.1 
 
 		 402 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  39.85 
 
 		 401 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  41.92 
 
 		 401 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  41.92 
 
 		 401 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  37.79 
 
 		 402 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  43.8 
 
 		 407 aa  266  5e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  42.86 
 
 		 406 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  39.95 
 
 		 408 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  38.72 
 
 		 402 aa  265  1e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  41.92 
 
 		 400 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  43.86 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  43.48 
 
 		 411 aa  259  8e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  44.06 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  35.18 
 
 		 404 aa  255  9e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  41.04 
 
 		 411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  41.65 
 
 		 416 aa  255  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  39.38 
 
 		 395 aa  254  1.0000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  41.58 
 
 		 400 aa  252  7e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  46.71 
 
 		 320 aa  252  8.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  42.08 
 
 		 409 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  36.07 
 
 		 408 aa  251  1e-65  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  40.2 
 
 		 408 aa  251  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  41.88 
 
 		 410 aa  250  3e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  41.62 
 
 		 415 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  40.74 
 
 		 413 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  36.76 
 
 		 537 aa  248  2e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  38.52 
 
 		 416 aa  248  2e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  40.79 
 
 		 403 aa  241  2e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  38.25 
 
 		 406 aa  240  4e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0057  threonine dehydratase  41.6 
 
 		 410 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.835911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  41.8 
 
 		 414 aa  237  3e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  40.05 
 
 		 403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  41.16 
 
 		 421 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  37.22 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2664  threonine dehydratase  41.11 
 
 		 415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2254  threonine dehydratase  41.24 
 
 		 415 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  40.34 
 
 		 412 aa  232  9e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  40.25 
 
 		 415 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  34.61 
 
 		 401 aa  227  2e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  42.67 
 
 		 402 aa  227  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0289  threonine dehydratase  42.46 
 
 		 442 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.122969 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0080  threonine dehydratase  41.52 
 
 		 399 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0099  threonine dehydratase  41.52 
 
 		 399 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  40.48 
 
 		 511 aa  226  7e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3319  threonine dehydratase  39.75 
 
 		 410 aa  226  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.813213  normal  0.377065 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  38.68 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1939  threonine dehydratase  37.08 
 
 		 410 aa  223  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4359  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.54 
 
 		 321 aa  223  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  39.48 
 
 		 402 aa  222  8e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  37.57 
 
 		 514 aa  219  6e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>