43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2608 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2608  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  500  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0684  hypothetical protein  97.15 
 
 		 256 aa  397  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3733  hypothetical protein  95.12 
 
 		 256 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199319  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31130  hypothetical protein  91.41 
 
 		 256 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514667  unclonable  1.26919e-22 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36000  hypothetical protein  87.84 
 
 		 260 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4164  hypothetical protein  71.94 
 
 		 265 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1983  hypothetical protein  88.98 
 
 		 272 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247062  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2327  hypothetical protein  80.88 
 
 		 265 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1261  hypothetical protein  74.1 
 
 		 265 aa  338  5e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1252  hypothetical protein  69.11 
 
 		 290 aa  317  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0855009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1286  hypothetical protein  69.51 
 
 		 253 aa  315  5e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2651  hypothetical protein  68.7 
 
 		 253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598779  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1876  hypothetical protein  68.29 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.184219  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3528  hypothetical protein  67.49 
 
 		 253 aa  301  5.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2727  hypothetical protein  68.7 
 
 		 254 aa  301  6.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3026  hypothetical protein  68.7 
 
 		 252 aa  301  7.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0459  hypothetical protein  68.83 
 
 		 257 aa  295  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.445694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2935  hypothetical protein  68.7 
 
 		 249 aa  293  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1483  hypothetical protein  67.2 
 
 		 263 aa  274  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2618  hypothetical protein  68.85 
 
 		 249 aa  262  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1140  hypothetical protein  61.04 
 
 		 261 aa  244  8e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  32.44 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  32.35 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3567  hypothetical protein  23.39 
 
 		 247 aa  49.3  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0765  hypothetical protein  23.39 
 
 		 247 aa  49.3  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000339675  normal  0.0299181 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3438  hypothetical protein  23.39 
 
 		 247 aa  49.3  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000158666  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  48.39 
 
 		 192 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3560  hypothetical protein  38.55 
 
 		 148 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  45.76 
 
 		 173 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0761  hypothetical protein  43.1 
 
 		 169 aa  46.2  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0712  hypothetical protein  41.07 
 
 		 205 aa  46.2  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1981  hypothetical protein  47.69 
 
 		 273 aa  45.8  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7429  hypothetical protein  44.44 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751032 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3838  hypothetical protein  49.09 
 
 		 163 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788301  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2866  hypothetical protein  45.76 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.0242431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7727  hypothetical protein  41.94 
 
 		 106 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0599246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3174  hypothetical protein  42.11 
 
 		 150 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1036  hypothetical protein  43.48 
 
 		 138 aa  43.5  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2339  hypothetical protein  34.15 
 
 		 148 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0526  hypothetical protein  42.37 
 
 		 107 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0525  hypothetical protein  47.27 
 
 		 174 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4017  hypothetical protein  43.1 
 
 		 207 aa  42.7  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3912  hypothetical protein  46.43 
 
 		 63 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>