42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3560 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3560  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  302  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2339  hypothetical protein  66.9 
 
 		 148 aa  200  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  42.66 
 
 		 192 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  42.14 
 
 		 173 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1487  hypothetical protein  44.06 
 
 		 211 aa  84  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1036  hypothetical protein  40.83 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7429  hypothetical protein  40.62 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0761  hypothetical protein  38.28 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0127  hypothetical protein  35.46 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488443  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2866  hypothetical protein  36.36 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.0242431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4017  hypothetical protein  36.04 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3365  hypothetical protein  36.13 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828629  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3838  hypothetical protein  35.07 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788301  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4164  hypothetical protein  43.42 
 
 		 265 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0579  hypothetical protein  34.23 
 
 		 185 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1286  hypothetical protein  43.82 
 
 		 253 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2651  hypothetical protein  47.37 
 
 		 253 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598779  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3815  hypothetical protein  35.65 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.757001 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3528  hypothetical protein  41.05 
 
 		 253 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  33.82 
 
 		 248 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3026  hypothetical protein  42.68 
 
 		 252 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2727  hypothetical protein  42.68 
 
 		 254 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1876  hypothetical protein  46.05 
 
 		 253 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.184219  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2327  hypothetical protein  44.44 
 
 		 265 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1483  hypothetical protein  45.21 
 
 		 263 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2935  hypothetical protein  47.76 
 
 		 249 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1206  hypothetical protein  34.06 
 
 		 176 aa  47.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3529  hypothetical protein  34.06 
 
 		 176 aa  47.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.452767  normal  0.831541 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36000  hypothetical protein  46.05 
 
 		 260 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1252  hypothetical protein  46.27 
 
 		 290 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0855009 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2618  hypothetical protein  42.42 
 
 		 249 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0525  hypothetical protein  37.74 
 
 		 174 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0459  hypothetical protein  37.97 
 
 		 257 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.445694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  33.03 
 
 		 261 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3733  hypothetical protein  44.93 
 
 		 256 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199319  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1261  hypothetical protein  44.78 
 
 		 265 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1140  hypothetical protein  45.21 
 
 		 261 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1983  hypothetical protein  43.42 
 
 		 272 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247062  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2496  hypothetical protein  30.77 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1981  hypothetical protein  36 
 
 		 273 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0712  hypothetical protein  25.53 
 
 		 205 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31130  hypothetical protein  42.11 
 
 		 256 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514667  unclonable  1.26919e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>