36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_31130 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_31130  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514667  unclonable  1.26919e-22 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2608  hypothetical protein  91.46 
 
 		 256 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3733  hypothetical protein  91.87 
 
 		 256 aa  371  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199319  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4164  hypothetical protein  72.33 
 
 		 265 aa  371  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0684  hypothetical protein  90.24 
 
 		 256 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36000  hypothetical protein  84.23 
 
 		 260 aa  363  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1983  hypothetical protein  87.8 
 
 		 272 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247062  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2327  hypothetical protein  78.26 
 
 		 265 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1261  hypothetical protein  70.36 
 
 		 265 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1286  hypothetical protein  68.29 
 
 		 253 aa  310  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2651  hypothetical protein  67.89 
 
 		 253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598779  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1252  hypothetical protein  67.48 
 
 		 290 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0855009 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1876  hypothetical protein  67.89 
 
 		 253 aa  304  8.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.184219  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2727  hypothetical protein  68.29 
 
 		 254 aa  304  9.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3026  hypothetical protein  68.29 
 
 		 252 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3528  hypothetical protein  67.89 
 
 		 253 aa  301  6.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0459  hypothetical protein  68 
 
 		 257 aa  291  6e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.445694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2935  hypothetical protein  68.7 
 
 		 249 aa  287  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1483  hypothetical protein  66.4 
 
 		 263 aa  270  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2618  hypothetical protein  67.89 
 
 		 249 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1140  hypothetical protein  59.84 
 
 		 261 aa  234  8e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  30.92 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  32.77 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3560  hypothetical protein  42.11 
 
 		 148 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3838  hypothetical protein  50 
 
 		 163 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788301  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2339  hypothetical protein  39.47 
 
 		 148 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3438  hypothetical protein  21.86 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000158666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0765  hypothetical protein  21.86 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000339675  normal  0.0299181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  44.07 
 
 		 173 aa  45.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3567  hypothetical protein  21.86 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  46.77 
 
 		 192 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3174  hypothetical protein  36.26 
 
 		 150 aa  43.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1036  hypothetical protein  46.88 
 
 		 138 aa  43.5  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0712  hypothetical protein  42.86 
 
 		 205 aa  43.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0526  hypothetical protein  55.88 
 
 		 107 aa  42  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0525  hypothetical protein  45.45 
 
 		 174 aa  42  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>