29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1483 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1483  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  508  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1286  hypothetical protein  82.13 
 
 		 253 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2651  hypothetical protein  81.75 
 
 		 253 aa  403  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598779  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1252  hypothetical protein  80.99 
 
 		 290 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0855009 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1876  hypothetical protein  80.99 
 
 		 253 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.184219  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3528  hypothetical protein  79.47 
 
 		 253 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2727  hypothetical protein  78.71 
 
 		 254 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3026  hypothetical protein  78.71 
 
 		 252 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0459  hypothetical protein  79.85 
 
 		 257 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.445694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2935  hypothetical protein  78.33 
 
 		 249 aa  367  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2618  hypothetical protein  79.47 
 
 		 249 aa  342  5e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4164  hypothetical protein  62.98 
 
 		 265 aa  305  6e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1261  hypothetical protein  66.41 
 
 		 265 aa  290  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2327  hypothetical protein  62.96 
 
 		 265 aa  271  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36000  hypothetical protein  66.41 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1983  hypothetical protein  63.57 
 
 		 272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247062  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31130  hypothetical protein  66.4 
 
 		 256 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514667  unclonable  1.26919e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3733  hypothetical protein  67.34 
 
 		 256 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199319  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2608  hypothetical protein  66.4 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0684  hypothetical protein  65.18 
 
 		 256 aa  240  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1140  hypothetical protein  55.85 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  29.28 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  27.16 
 
 		 248 aa  53.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3560  hypothetical protein  45.21 
 
 		 148 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2339  hypothetical protein  41.38 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7727  hypothetical protein  39.39 
 
 		 106 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0599246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  43.28 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7429  hypothetical protein  42.86 
 
 		 185 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  44.07 
 
 		 173 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>