43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1810 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  534  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  32.93 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3026  hypothetical protein  30.47 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2727  hypothetical protein  30.47 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1876  hypothetical protein  31.78 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.184219  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1252  hypothetical protein  31.92 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0855009 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4164  hypothetical protein  29.77 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2935  hypothetical protein  32.57 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2651  hypothetical protein  29.84 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598779  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2618  hypothetical protein  29.07 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1483  hypothetical protein  30.22 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3528  hypothetical protein  28.41 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1140  hypothetical protein  28.9 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2608  hypothetical protein  32.05 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36000  hypothetical protein  33.09 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1286  hypothetical protein  29.46 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2866  hypothetical protein  29.28 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.0242431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3733  hypothetical protein  32.18 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199319  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0684  hypothetical protein  32.05 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0459  hypothetical protein  28.06 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.445694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1981  hypothetical protein  32.59 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2327  hypothetical protein  30.91 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3681  hypothetical protein  28.08 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1261  hypothetical protein  30.11 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3567  hypothetical protein  23.35 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3438  hypothetical protein  23.35 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000158666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0765  hypothetical protein  23.35 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000339675  normal  0.0299181 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1983  hypothetical protein  30.3 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247062  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0579  hypothetical protein  45.59 
 
 		 185 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  31.09 
 
 		 192 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31130  hypothetical protein  30 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514667  unclonable  1.26919e-22 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3529  hypothetical protein  42.65 
 
 		 176 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.452767  normal  0.831541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1206  hypothetical protein  42.65 
 
 		 176 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1514  hypothetical protein  35.96 
 
 		 131 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1036  hypothetical protein  41.33 
 
 		 138 aa  47  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4017  hypothetical protein  40.3 
 
 		 207 aa  45.8  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  41.79 
 
 		 173 aa  45.4  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3174  hypothetical protein  34.82 
 
 		 150 aa  45.4  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0712  hypothetical protein  45 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3074  hypothetical protein  28.57 
 
 		 177 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.426221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3017  hypothetical protein  28.28 
 
 		 177 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0525  hypothetical protein  33.03 
 
 		 174 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3560  hypothetical protein  33.03 
 
 		 148 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>