31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2618 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2618  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3026  hypothetical protein  89.68 
 
 		 252 aa  427  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2727  hypothetical protein  89.68 
 
 		 254 aa  428  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1252  hypothetical protein  82.21 
 
 		 290 aa  400  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0855009 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2935  hypothetical protein  89.16 
 
 		 249 aa  403  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1286  hypothetical protein  83.07 
 
 		 253 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1876  hypothetical protein  81.42 
 
 		 253 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.184219  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3528  hypothetical protein  81.03 
 
 		 253 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2651  hypothetical protein  81.89 
 
 		 253 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598779  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0459  hypothetical protein  80.54 
 
 		 257 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.445694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1483  hypothetical protein  79.47 
 
 		 263 aa  358  5e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4164  hypothetical protein  65.12 
 
 		 265 aa  311  7.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1261  hypothetical protein  64.23 
 
 		 265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2327  hypothetical protein  68.05 
 
 		 265 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36000  hypothetical protein  67.44 
 
 		 260 aa  271  7e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1983  hypothetical protein  68.42 
 
 		 272 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247062  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31130  hypothetical protein  67.89 
 
 		 256 aa  255  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514667  unclonable  1.26919e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3733  hypothetical protein  68.75 
 
 		 256 aa  252  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199319  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2608  hypothetical protein  68.2 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0684  hypothetical protein  66.53 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1140  hypothetical protein  55.81 
 
 		 261 aa  206  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  31.54 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  29.49 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3560  hypothetical protein  39.51 
 
 		 148 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3567  hypothetical protein  22.46 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0765  hypothetical protein  22.46 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000339675  normal  0.0299181 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3438  hypothetical protein  22.46 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000158666  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  46.67 
 
 		 173 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  44.78 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2339  hypothetical protein  35 
 
 		 148 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7429  hypothetical protein  44.44 
 
 		 185 aa  42.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>