42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3733 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3733  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  497  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199319  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2608  hypothetical protein  95.12 
 
 
256 aa  388  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245764  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0684  hypothetical protein  93.5 
 
 
256 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36000  hypothetical protein  88.24 
 
 
260 aa  377  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1983  hypothetical protein  91.73 
 
 
272 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247062  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4164  hypothetical protein  72.73 
 
 
265 aa  374  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31130  hypothetical protein  91.8 
 
 
256 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514667  unclonable  1.26919e-22 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2327  hypothetical protein  82.87 
 
 
265 aa  362  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1261  hypothetical protein  73.31 
 
 
265 aa  334  9e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1252  hypothetical protein  70.04 
 
 
290 aa  324  8.000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0855009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1286  hypothetical protein  70.45 
 
 
253 aa  322  5e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2651  hypothetical protein  69.64 
 
 
253 aa  319  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598779  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1876  hypothetical protein  69.23 
 
 
253 aa  313  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.184219  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2727  hypothetical protein  69.23 
 
 
254 aa  308  5e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492193  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3026  hypothetical protein  69.23 
 
 
252 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3528  hypothetical protein  68.44 
 
 
253 aa  307  9e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0459  hypothetical protein  69.64 
 
 
257 aa  301  5.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.445694  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2935  hypothetical protein  68.42 
 
 
249 aa  298  4e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1483  hypothetical protein  68.13 
 
 
263 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2618  hypothetical protein  69.39 
 
 
249 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109869  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1140  hypothetical protein  61.04 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  32.44 
 
 
261 aa  79  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  33.33 
 
 
248 aa  72  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3560  hypothetical protein  40.96 
 
 
148 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0765  hypothetical protein  23.79 
 
 
247 aa  52  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000339675  normal  0.0299181 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3567  hypothetical protein  23.79 
 
 
247 aa  52  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3438  hypothetical protein  23.79 
 
 
247 aa  52  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000158666  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  47.46 
 
 
173 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2339  hypothetical protein  36.59 
 
 
148 aa  50.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3838  hypothetical protein  51.79 
 
 
163 aa  50.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788301  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  48.39 
 
 
192 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3174  hypothetical protein  43.86 
 
 
150 aa  46.2  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0712  hypothetical protein  42.86 
 
 
205 aa  45.8  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1036  hypothetical protein  44.93 
 
 
138 aa  45.8  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128051  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0761  hypothetical protein  43.1 
 
 
169 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7727  hypothetical protein  40.91 
 
 
106 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0599246  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1981  hypothetical protein  47.69 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0525  hypothetical protein  49.09 
 
 
174 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2866  hypothetical protein  43.55 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.0242431 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0526  hypothetical protein  41.67 
 
 
107 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7429  hypothetical protein  42.86 
 
 
185 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0751032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0579  hypothetical protein  44.83 
 
 
185 aa  42.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336002  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>