35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2866 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2866  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  474  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.0242431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0761  hypothetical protein  77.51 
 
 
169 aa  253  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0579  hypothetical protein  38.25 
 
 
185 aa  102  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336002  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4017  hypothetical protein  36.68 
 
 
207 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0127  hypothetical protein  44.12 
 
 
149 aa  93.2  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488443  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0712  hypothetical protein  34.47 
 
 
205 aa  92  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3365  hypothetical protein  44.25 
 
 
124 aa  85.5  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828629  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2796  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  84.7  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232161  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3681  hypothetical protein  41.18 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  36.65 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3174  hypothetical protein  40.8 
 
 
150 aa  82  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3838  hypothetical protein  45 
 
 
163 aa  81.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788301  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  44.55 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  32.31 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1487  hypothetical protein  35.35 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7429  hypothetical protein  43.64 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0751032 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3074  hypothetical protein  37.25 
 
 
177 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.426221  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1036  hypothetical protein  42.98 
 
 
138 aa  71.2  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128051  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0525  hypothetical protein  33.14 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  29.28 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3017  hypothetical protein  34.97 
 
 
177 aa  59.3  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3560  hypothetical protein  36.36 
 
 
148 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3182  hypothetical protein  48.48 
 
 
167 aa  58.9  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860952  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2339  hypothetical protein  34.75 
 
 
148 aa  58.5  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0983  hypothetical protein  31.94 
 
 
173 aa  57.8  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0672895  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3815  hypothetical protein  38.94 
 
 
124 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.757001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7729  hypothetical protein  50 
 
 
62 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0250143  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3529  hypothetical protein  31.11 
 
 
176 aa  55.1  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.452767  normal  0.831541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1206  hypothetical protein  31.11 
 
 
176 aa  55.1  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1514  hypothetical protein  38.96 
 
 
131 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3067  hypothetical protein  46.81 
 
 
58 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2626  hypothetical protein  36.94 
 
 
114 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2496  hypothetical protein  30.28 
 
 
169 aa  42.4  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4164  hypothetical protein  44.07 
 
 
265 aa  42  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2327  hypothetical protein  41.94 
 
 
265 aa  41.6  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>