12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2626 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2626  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  224  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2496  hypothetical protein  48.25 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3681  hypothetical protein  39.42 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  40.37 
 
 		 192 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2339  hypothetical protein  35.71 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2866  hypothetical protein  36.94 
 
 		 237 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.0242431 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2796  hypothetical protein  34.48 
 
 		 203 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0127  hypothetical protein  30 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488443  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3365  hypothetical protein  30.91 
 
 		 124 aa  42.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828629  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0983  hypothetical protein  33.04 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0672895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3074  hypothetical protein  33.67 
 
 		 177 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.426221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0761  hypothetical protein  35.4 
 
 		 169 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.900094 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>