30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2339 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2339  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  297  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3560  hypothetical protein  66.9 
 
 		 148 aa  200  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  45.45 
 
 		 192 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  41.43 
 
 		 173 aa  94  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1487  hypothetical protein  40.56 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7429  hypothetical protein  42.74 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1036  hypothetical protein  38.98 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3838  hypothetical protein  37.31 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788301  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2866  hypothetical protein  34.75 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.0242431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0761  hypothetical protein  38.05 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0579  hypothetical protein  33.6 
 
 		 185 aa  53.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4017  hypothetical protein  28.78 
 
 		 207 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0127  hypothetical protein  33.1 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488443  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4164  hypothetical protein  39.47 
 
 		 265 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3026  hypothetical protein  32.41 
 
 		 252 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2727  hypothetical protein  32.19 
 
 		 254 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0712  hypothetical protein  27.94 
 
 		 205 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1286  hypothetical protein  39.33 
 
 		 253 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2651  hypothetical protein  42.11 
 
 		 253 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598779  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2327  hypothetical protein  41.27 
 
 		 265 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1876  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.184219  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1483  hypothetical protein  41.38 
 
 		 263 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3528  hypothetical protein  35.37 
 
 		 253 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2626  hypothetical protein  35.71 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2496  hypothetical protein  31.54 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0525  hypothetical protein  34.26 
 
 		 174 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0459  hypothetical protein  26.62 
 
 		 257 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.445694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2935  hypothetical protein  42.86 
 
 		 249 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1252  hypothetical protein  40.79 
 
 		 290 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0855009 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36000  hypothetical protein  36.84 
 
 		 260 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>