29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0127 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0127  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  293  7e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488443  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3365  hypothetical protein  89.52 
 
 		 124 aa  221  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828629  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2866  hypothetical protein  44.12 
 
 		 237 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.0242431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0761  hypothetical protein  40.3 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2796  hypothetical protein  35.46 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3681  hypothetical protein  36.11 
 
 		 258 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4017  hypothetical protein  39.5 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3074  hypothetical protein  37.82 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.426221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0579  hypothetical protein  36.13 
 
 		 185 aa  67  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3560  hypothetical protein  35.46 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  32.86 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3174  hypothetical protein  41.12 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3017  hypothetical protein  35.66 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3838  hypothetical protein  36.76 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788301  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1514  hypothetical protein  36.67 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1036  hypothetical protein  35.71 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  32.89 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3182  hypothetical protein  42.61 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860952  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0525  hypothetical protein  36.79 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2339  hypothetical protein  33.1 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0983  hypothetical protein  32.08 
 
 		 173 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0672895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  33.04 
 
 		 248 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3529  hypothetical protein  33.85 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.452767  normal  0.831541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1206  hypothetical protein  33.85 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7429  hypothetical protein  32.48 
 
 		 185 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1487  hypothetical protein  31.03 
 
 		 211 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2626  hypothetical protein  30 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3815  hypothetical protein  34.21 
 
 		 124 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.757001 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0712  hypothetical protein  29.41 
 
 		 205 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>