43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3345 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  342  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  52.26 
 
 		 192 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1487  hypothetical protein  50.64 
 
 		 211 aa  121  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3560  hypothetical protein  42.14 
 
 		 148 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7429  hypothetical protein  42.19 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751032 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2339  hypothetical protein  41.43 
 
 		 148 aa  94  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0579  hypothetical protein  45.61 
 
 		 185 aa  87.8  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1036  hypothetical protein  44.54 
 
 		 138 aa  84.3  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4017  hypothetical protein  39.2 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0761  hypothetical protein  43.33 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2866  hypothetical protein  44.55 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.0242431 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3838  hypothetical protein  37.78 
 
 		 163 aa  72  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788301  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  35.77 
 
 		 248 aa  70.9  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3529  hypothetical protein  47.42 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.452767  normal  0.831541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1206  hypothetical protein  47.42 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0127  hypothetical protein  32.86 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488443  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0525  hypothetical protein  37.88 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0712  hypothetical protein  36.29 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3815  hypothetical protein  43.64 
 
 		 124 aa  62  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.757001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7729  hypothetical protein  53.85 
 
 		 62 aa  57.8  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0250143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3174  hypothetical protein  36.19 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3017  hypothetical protein  27.95 
 
 		 177 aa  52  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1514  hypothetical protein  36.11 
 
 		 131 aa  51.6  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3074  hypothetical protein  26.71 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.426221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4164  hypothetical protein  45.76 
 
 		 265 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3365  hypothetical protein  30.77 
 
 		 124 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828629  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2327  hypothetical protein  44.07 
 
 		 265 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2651  hypothetical protein  45.76 
 
 		 253 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598779  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2796  hypothetical protein  27.59 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3528  hypothetical protein  45 
 
 		 253 aa  45.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  41.79 
 
 		 261 aa  45.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3681  hypothetical protein  32.11 
 
 		 258 aa  45.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3026  hypothetical protein  46.67 
 
 		 252 aa  45.1  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2727  hypothetical protein  46.67 
 
 		 254 aa  44.7  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2935  hypothetical protein  45 
 
 		 249 aa  44.3  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2618  hypothetical protein  46.67 
 
 		 249 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1483  hypothetical protein  44.07 
 
 		 263 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1252  hypothetical protein  44.07 
 
 		 290 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0855009 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3182  hypothetical protein  37.76 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860952  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1286  hypothetical protein  45 
 
 		 253 aa  43.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1876  hypothetical protein  44.07 
 
 		 253 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.184219  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0459  hypothetical protein  43.33 
 
 		 257 aa  41.2  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.445694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3067  hypothetical protein  41.18 
 
 		 58 aa  41.2  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.205429 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>