30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1036 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1036  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  268  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128051  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7429  hypothetical protein  44.36 
 
 
185 aa  90.9  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0751032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  44.54 
 
 
173 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  41.3 
 
 
192 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3560  hypothetical protein  40.83 
 
 
148 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2866  hypothetical protein  42.98 
 
 
237 aa  71.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.0242431 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2339  hypothetical protein  38.98 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0761  hypothetical protein  41.28 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0579  hypothetical protein  37.72 
 
 
185 aa  63.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336002  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1487  hypothetical protein  45.22 
 
 
211 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4017  hypothetical protein  35.14 
 
 
207 aa  58.2  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0712  hypothetical protein  33.93 
 
 
205 aa  57.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0127  hypothetical protein  35.71 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488443  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3365  hypothetical protein  34.82 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828629  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3838  hypothetical protein  39.62 
 
 
163 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788301  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3681  hypothetical protein  33.94 
 
 
258 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3182  hypothetical protein  38.78 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860952  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  41.33 
 
 
261 aa  47  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3815  hypothetical protein  33.62 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.757001 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4164  hypothetical protein  45.59 
 
 
265 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3529  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.452767  normal  0.831541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1206  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3074  hypothetical protein  30.17 
 
 
177 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.426221  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3017  hypothetical protein  33.61 
 
 
177 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2327  hypothetical protein  43.55 
 
 
265 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  34.86 
 
 
248 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1514  hypothetical protein  36.71 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2727  hypothetical protein  42.86 
 
 
254 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492193  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3026  hypothetical protein  42.86 
 
 
252 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3528  hypothetical protein  42.86 
 
 
253 aa  40.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>