36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4164 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008757  Pnap_4164  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  531  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2327  hypothetical protein  73.58 
 
 
265 aa  345  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1261  hypothetical protein  67.92 
 
 
265 aa  334  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1252  hypothetical protein  65.5 
 
 
290 aa  323  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0855009 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2651  hypothetical protein  67.05 
 
 
253 aa  323  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598779  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1286  hypothetical protein  66.67 
 
 
253 aa  322  5e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2727  hypothetical protein  66.28 
 
 
254 aa  317  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492193  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3026  hypothetical protein  66.28 
 
 
252 aa  317  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36000  hypothetical protein  72.37 
 
 
260 aa  317  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1983  hypothetical protein  69.66 
 
 
272 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247062  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1876  hypothetical protein  64.75 
 
 
253 aa  315  4e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.184219  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3733  hypothetical protein  72.36 
 
 
256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199319  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2608  hypothetical protein  71.54 
 
 
256 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245764  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31130  hypothetical protein  72.33 
 
 
256 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514667  unclonable  1.26919e-22 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0684  hypothetical protein  70.73 
 
 
256 aa  309  4e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3528  hypothetical protein  65.12 
 
 
253 aa  308  4e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0459  hypothetical protein  66.03 
 
 
257 aa  305  5.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.445694  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2935  hypothetical protein  65.89 
 
 
249 aa  300  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1483  hypothetical protein  62.98 
 
 
263 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2618  hypothetical protein  65.12 
 
 
249 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109869  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1140  hypothetical protein  60 
 
 
261 aa  258  9e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  29.77 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3560  hypothetical protein  43.42 
 
 
148 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  50 
 
 
192 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2339  hypothetical protein  39.47 
 
 
148 aa  50.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  45.76 
 
 
173 aa  49.3  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3838  hypothetical protein  49.09 
 
 
163 aa  49.3  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788301  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3438  hypothetical protein  23.08 
 
 
247 aa  48.9  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000158666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0765  hypothetical protein  23.08 
 
 
247 aa  48.9  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000339675  normal  0.0299181 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3567  hypothetical protein  23.08 
 
 
247 aa  48.9  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  27.16 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2340  hypothetical protein  44.83 
 
 
65 aa  46.6  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.216829  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0526  hypothetical protein  45 
 
 
107 aa  46.6  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7727  hypothetical protein  40 
 
 
106 aa  45.8  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0599246  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1036  hypothetical protein  45.59 
 
 
138 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128051  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2866  hypothetical protein  44.07 
 
 
237 aa  42  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.0242431 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>