29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3815 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3815  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  240  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.757001 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4017  hypothetical protein  43.09 
 
 
207 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0579  hypothetical protein  43.09 
 
 
185 aa  99  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336002  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3838  hypothetical protein  42.98 
 
 
163 aa  92  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788301  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3174  hypothetical protein  40.35 
 
 
150 aa  90.5  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3074  hypothetical protein  38.71 
 
 
177 aa  87  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.426221  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  44.35 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3017  hypothetical protein  46.09 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0712  hypothetical protein  40.32 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3529  hypothetical protein  47.79 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.452767  normal  0.831541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1206  hypothetical protein  47.79 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  43.64 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0525  hypothetical protein  37.62 
 
 
174 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7429  hypothetical protein  39.82 
 
 
185 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0751032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0761  hypothetical protein  35.83 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2866  hypothetical protein  38.94 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.0242431 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1514  hypothetical protein  38.39 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3182  hypothetical protein  41.82 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860952  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1487  hypothetical protein  45 
 
 
211 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3560  hypothetical protein  35.65 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  34.75 
 
 
248 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1036  hypothetical protein  33.62 
 
 
138 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128051  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3681  hypothetical protein  36.94 
 
 
258 aa  53.5  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0127  hypothetical protein  34.21 
 
 
149 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488443  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7729  hypothetical protein  43.64 
 
 
62 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0250143  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3365  hypothetical protein  31.58 
 
 
124 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828629  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2339  hypothetical protein  30.58 
 
 
148 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0983  hypothetical protein  31.31 
 
 
173 aa  41.6  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0672895  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2496  hypothetical protein  36.59 
 
 
169 aa  40.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>