45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3838 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3838  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  312  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788301  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4017  hypothetical protein  50.96 
 
 
207 aa  136  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0579  hypothetical protein  49.07 
 
 
185 aa  136  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336002  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3074  hypothetical protein  44.37 
 
 
177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.426221  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0525  hypothetical protein  51.26 
 
 
174 aa  106  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3174  hypothetical protein  48.48 
 
 
150 aa  103  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3017  hypothetical protein  42.24 
 
 
177 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3529  hypothetical protein  47.89 
 
 
176 aa  95.5  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.452767  normal  0.831541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1206  hypothetical protein  47.89 
 
 
176 aa  95.5  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0712  hypothetical protein  44.88 
 
 
205 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3815  hypothetical protein  43.9 
 
 
124 aa  85.5  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.757001 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2866  hypothetical protein  43.15 
 
 
237 aa  84.7  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.0242431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0761  hypothetical protein  44.09 
 
 
169 aa  84  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3182  hypothetical protein  44.35 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860952  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  39.01 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  39.74 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1514  hypothetical protein  41.96 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0127  hypothetical protein  38.1 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488443  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  34.04 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3365  hypothetical protein  41.96 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828629  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2339  hypothetical protein  38.41 
 
 
148 aa  63.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1036  hypothetical protein  41.82 
 
 
138 aa  60.5  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128051  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3681  hypothetical protein  34.18 
 
 
258 aa  60.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7729  hypothetical protein  56.36 
 
 
62 aa  60.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0250143  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7429  hypothetical protein  36.8 
 
 
185 aa  58.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0751032 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3560  hypothetical protein  35.25 
 
 
148 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1487  hypothetical protein  36.54 
 
 
211 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4164  hypothetical protein  50.85 
 
 
265 aa  54.3  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2327  hypothetical protein  35.29 
 
 
265 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0983  hypothetical protein  28.06 
 
 
173 aa  52.4  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0672895  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2796  hypothetical protein  31.69 
 
 
203 aa  48.9  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232161  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3067  hypothetical protein  56.25 
 
 
58 aa  47.8  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1483  hypothetical protein  49.15 
 
 
263 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  42.65 
 
 
261 aa  44.3  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1252  hypothetical protein  46.67 
 
 
290 aa  43.9  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0855009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1286  hypothetical protein  45.76 
 
 
253 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2618  hypothetical protein  49.15 
 
 
249 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109869  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2727  hypothetical protein  48.33 
 
 
254 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492193  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3026  hypothetical protein  48.33 
 
 
252 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2651  hypothetical protein  45 
 
 
253 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598779  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2935  hypothetical protein  46.67 
 
 
249 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1876  hypothetical protein  43.33 
 
 
253 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.184219  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1981  hypothetical protein  44.62 
 
 
273 aa  42  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0459  hypothetical protein  46.67 
 
 
257 aa  42  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.445694  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3528  hypothetical protein  44.07 
 
 
253 aa  41.2  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>