27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0459 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0459  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  502  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.445694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1286  hypothetical protein  86.38 
 
 		 253 aa  428  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3528  hypothetical protein  83.66 
 
 		 253 aa  412  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1252  hypothetical protein  82.49 
 
 		 290 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0855009 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1876  hypothetical protein  82.88 
 
 		 253 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.184219  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2651  hypothetical protein  83.27 
 
 		 253 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598779  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3026  hypothetical protein  79.77 
 
 		 252 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2727  hypothetical protein  79.77 
 
 		 254 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2935  hypothetical protein  78.99 
 
 		 249 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1483  hypothetical protein  77.57 
 
 		 263 aa  356  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2618  hypothetical protein  80.54 
 
 		 249 aa  347  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4164  hypothetical protein  66.03 
 
 		 265 aa  312  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1261  hypothetical protein  64.12 
 
 		 265 aa  287  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2327  hypothetical protein  64.12 
 
 		 265 aa  275  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36000  hypothetical protein  67.72 
 
 		 260 aa  268  8e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3733  hypothetical protein  69.14 
 
 		 256 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199319  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31130  hypothetical protein  67.6 
 
 		 256 aa  258  8e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514667  unclonable  1.26919e-22 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1983  hypothetical protein  64.39 
 
 		 272 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247062  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2608  hypothetical protein  68.31 
 
 		 256 aa  255  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0684  hypothetical protein  66.26 
 
 		 256 aa  248  8e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1140  hypothetical protein  55.85 
 
 		 261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  29.39 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  28.87 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3438  hypothetical protein  22.88 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000158666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3567  hypothetical protein  22.88 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0765  hypothetical protein  22.88 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000339675  normal  0.0299181 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3560  hypothetical protein  37.97 
 
 		 148 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>