30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1140 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1140  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  509  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4164  hypothetical protein  60 
 
 
265 aa  298  8e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1261  hypothetical protein  57.74 
 
 
265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2327  hypothetical protein  61.89 
 
 
265 aa  265  7e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2651  hypothetical protein  56.65 
 
 
253 aa  256  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598779  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1286  hypothetical protein  55.56 
 
 
253 aa  255  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3528  hypothetical protein  55.56 
 
 
253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1252  hypothetical protein  55.56 
 
 
290 aa  252  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0855009 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1876  hypothetical protein  55.94 
 
 
253 aa  251  6e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.184219  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3733  hypothetical protein  61.22 
 
 
256 aa  245  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199319  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0684  hypothetical protein  61.63 
 
 
256 aa  244  8e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2608  hypothetical protein  61.22 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245764  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36000  hypothetical protein  61.66 
 
 
260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0459  hypothetical protein  55.85 
 
 
257 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.445694  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3026  hypothetical protein  55.81 
 
 
252 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2727  hypothetical protein  55.81 
 
 
254 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492193  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1983  hypothetical protein  59 
 
 
272 aa  235  7e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247062  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2935  hypothetical protein  55.43 
 
 
249 aa  231  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31130  hypothetical protein  59.44 
 
 
256 aa  231  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514667  unclonable  1.26919e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1483  hypothetical protein  55.85 
 
 
263 aa  225  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2618  hypothetical protein  55.81 
 
 
249 aa  205  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109869  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  30.18 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  32.38 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3560  hypothetical protein  45.21 
 
 
148 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2339  hypothetical protein  42.47 
 
 
148 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3567  hypothetical protein  22.76 
 
 
247 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0765  hypothetical protein  22.76 
 
 
247 aa  47  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000339675  normal  0.0299181 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3438  hypothetical protein  22.76 
 
 
247 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000158666  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1981  hypothetical protein  34.46 
 
 
273 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7727  hypothetical protein  40.98 
 
 
106 aa  42.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0599246  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>