15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7727 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7727  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  212  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0599246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0526  hypothetical protein  52.31 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3181  hypothetical protein  47.56 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0188675  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3173  hypothetical protein  50.77 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3837  hypothetical protein  45.71 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0738372  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3073  hypothetical protein  43.21 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1515  hypothetical protein  45.88 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3018  hypothetical protein  42.25 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3814  hypothetical protein  46.88 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4164  hypothetical protein  40 
 
 		 265 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1483  hypothetical protein  40 
 
 		 263 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2340  hypothetical protein  37.93 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.216829  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1261  hypothetical protein  40.32 
 
 		 265 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2795  hypothetical protein  40.58 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.308254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1140  hypothetical protein  40.98 
 
 		 261 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>