14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2340 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2340  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  136  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.216829  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3837  hypothetical protein  53.33 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0738372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3018  hypothetical protein  50 
 
 
74 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3912  hypothetical protein  46.03 
 
 
63 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3173  hypothetical protein  38.98 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3181  hypothetical protein  40 
 
 
98 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0188675  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3073  hypothetical protein  38.98 
 
 
102 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482766  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1515  hypothetical protein  36.67 
 
 
119 aa  47  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0526  hypothetical protein  38.33 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4164  hypothetical protein  44.83 
 
 
265 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2795  hypothetical protein  39.68 
 
 
71 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.308254  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1037  hypothetical protein  36.36 
 
 
132 aa  45.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.079184  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3344  hypothetical protein  39.68 
 
 
62 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.110426  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7727  hypothetical protein  37.93 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0599246  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>