18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0526 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0526  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  216  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3173  hypothetical protein  46.91 
 
 
102 aa  78.2  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3181  hypothetical protein  54.17 
 
 
98 aa  78.2  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0188675  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7727  hypothetical protein  52.31 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0599246  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3073  hypothetical protein  44.58 
 
 
102 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482766  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3837  hypothetical protein  43.66 
 
 
96 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0738372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3018  hypothetical protein  43.94 
 
 
74 aa  61.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1515  hypothetical protein  39.51 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3814  hypothetical protein  40.62 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2340  hypothetical protein  38.33 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.216829  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4164  hypothetical protein  45 
 
 
265 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3912  hypothetical protein  46.55 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36000  hypothetical protein  41.27 
 
 
260 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1483  hypothetical protein  37.7 
 
 
263 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3733  hypothetical protein  41.67 
 
 
256 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199319  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2795  hypothetical protein  41.43 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.308254  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1037  hypothetical protein  36.51 
 
 
132 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.079184  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2608  hypothetical protein  42.37 
 
 
256 aa  40.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245764  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>