38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1261 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1261  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  519  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4164  hypothetical protein  67.92 
 
 		 265 aa  355  3.9999999999999996e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2327  hypothetical protein  75.47 
 
 		 265 aa  348  6e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1252  hypothetical protein  67.44 
 
 		 290 aa  328  7e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0855009 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2651  hypothetical protein  65.89 
 
 		 253 aa  319  3e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598779  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1286  hypothetical protein  65.5 
 
 		 253 aa  318  5e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1876  hypothetical protein  65.12 
 
 		 253 aa  315  7e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.184219  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3528  hypothetical protein  65.12 
 
 		 253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36000  hypothetical protein  73.15 
 
 		 260 aa  301  5.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2727  hypothetical protein  63.57 
 
 		 254 aa  300  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3026  hypothetical protein  63.57 
 
 		 252 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0459  hypothetical protein  64.12 
 
 		 257 aa  298  6e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.445694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2935  hypothetical protein  62.79 
 
 		 249 aa  298  8e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2608  hypothetical protein  73.98 
 
 		 256 aa  298  8e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3733  hypothetical protein  73.17 
 
 		 256 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199319  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1983  hypothetical protein  71.71 
 
 		 272 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247062  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0684  hypothetical protein  71.95 
 
 		 256 aa  289  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31130  hypothetical protein  70.36 
 
 		 256 aa  287  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514667  unclonable  1.26919e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1483  hypothetical protein  66.41 
 
 		 263 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2618  hypothetical protein  63.85 
 
 		 249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1140  hypothetical protein  59.61 
 
 		 261 aa  250  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  30.11 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  31.65 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3560  hypothetical protein  44.78 
 
 		 148 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3438  hypothetical protein  21.22 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000158666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0765  hypothetical protein  21.22 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000339675  normal  0.0299181 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3567  hypothetical protein  21.22 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2339  hypothetical protein  41.67 
 
 		 148 aa  50.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3838  hypothetical protein  50.91 
 
 		 163 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788301  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  46.77 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1036  hypothetical protein  44.05 
 
 		 138 aa  46.6  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1981  hypothetical protein  45.33 
 
 		 273 aa  45.8  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7429  hypothetical protein  44.44 
 
 		 185 aa  45.4  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  40.98 
 
 		 173 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0525  hypothetical protein  47.27 
 
 		 174 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0712  hypothetical protein  41.38 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7727  hypothetical protein  40.32 
 
 		 106 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0599246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3174  hypothetical protein  40.35 
 
 		 150 aa  42.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>