42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0684 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0684  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  503  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2608  hypothetical protein  97.15 
 
 
256 aa  397  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245764  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3733  hypothetical protein  93.5 
 
 
256 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199319  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31130  hypothetical protein  90.23 
 
 
256 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514667  unclonable  1.26919e-22 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36000  hypothetical protein  87.45 
 
 
260 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1983  hypothetical protein  88.19 
 
 
272 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247062  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4164  hypothetical protein  71.15 
 
 
265 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2327  hypothetical protein  78.88 
 
 
265 aa  349  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1261  hypothetical protein  72.11 
 
 
265 aa  330  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1286  hypothetical protein  67.89 
 
 
253 aa  311  4.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1252  hypothetical protein  67.07 
 
 
290 aa  310  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0855009 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2651  hypothetical protein  67.48 
 
 
253 aa  310  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598779  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1876  hypothetical protein  66.67 
 
 
253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.184219  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3528  hypothetical protein  66.26 
 
 
253 aa  300  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2727  hypothetical protein  67.07 
 
 
254 aa  298  6e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492193  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3026  hypothetical protein  67.07 
 
 
252 aa  298  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0459  hypothetical protein  66.8 
 
 
257 aa  288  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.445694  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2935  hypothetical protein  67.48 
 
 
249 aa  286  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1483  hypothetical protein  66.13 
 
 
263 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2618  hypothetical protein  67.21 
 
 
249 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109869  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1140  hypothetical protein  61.45 
 
 
261 aa  246  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  32.44 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  32.77 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3560  hypothetical protein  38.55 
 
 
148 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  48.39 
 
 
192 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0765  hypothetical protein  22.27 
 
 
247 aa  47.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000339675  normal  0.0299181 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3567  hypothetical protein  22.27 
 
 
247 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  45.76 
 
 
173 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3438  hypothetical protein  22.27 
 
 
247 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000158666  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0761  hypothetical protein  43.1 
 
 
169 aa  46.2  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1981  hypothetical protein  47.69 
 
 
273 aa  45.8  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0712  hypothetical protein  41.07 
 
 
205 aa  45.8  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7429  hypothetical protein  44.44 
 
 
185 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0751032 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3838  hypothetical protein  48.21 
 
 
163 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788301  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2339  hypothetical protein  37.66 
 
 
148 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3174  hypothetical protein  42.11 
 
 
150 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7727  hypothetical protein  40.32 
 
 
106 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0599246  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2866  hypothetical protein  43.55 
 
 
237 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.0242431 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1036  hypothetical protein  43.48 
 
 
138 aa  43.5  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128051  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0525  hypothetical protein  47.27 
 
 
174 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4017  hypothetical protein  43.1 
 
 
207 aa  42.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0526  hypothetical protein  40.68 
 
 
107 aa  42  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>