28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2935 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2935  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  484  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2727  hypothetical protein  87.3 
 
 		 254 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3026  hypothetical protein  87.3 
 
 		 252 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1286  hypothetical protein  82.61 
 
 		 253 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1252  hypothetical protein  80.24 
 
 		 290 aa  394  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0855009 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2651  hypothetical protein  80.63 
 
 		 253 aa  390  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598779  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1876  hypothetical protein  81.03 
 
 		 253 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.184219  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3528  hypothetical protein  80.24 
 
 		 253 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2618  hypothetical protein  89.16 
 
 		 249 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0459  hypothetical protein  78.6 
 
 		 257 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.445694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1483  hypothetical protein  77.57 
 
 		 263 aa  353  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4164  hypothetical protein  65.89 
 
 		 265 aa  320  9.999999999999999e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1261  hypothetical protein  65.5 
 
 		 265 aa  285  4e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36000  hypothetical protein  68.99 
 
 		 260 aa  282  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2327  hypothetical protein  67.29 
 
 		 265 aa  275  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1983  hypothetical protein  65.9 
 
 		 272 aa  265  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247062  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31130  hypothetical protein  68.29 
 
 		 256 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514667  unclonable  1.26919e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3733  hypothetical protein  70.29 
 
 		 256 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199319  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2608  hypothetical protein  68.07 
 
 		 256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0684  hypothetical protein  66.81 
 
 		 256 aa  249  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1140  hypothetical protein  55.43 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  33.72 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  32.47 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3560  hypothetical protein  43.9 
 
 		 148 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2339  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  48.9  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  45 
 
 		 173 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2866  hypothetical protein  37.5 
 
 		 237 aa  42.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.0242431 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  43.28 
 
 		 192 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>