47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2247 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  491  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4017  hypothetical protein  34.67 
 
 
207 aa  92.4  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0579  hypothetical protein  35.71 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336002  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  32.93 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2866  hypothetical protein  32.31 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.0242431 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  31.94 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0761  hypothetical protein  39.32 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3174  hypothetical protein  37.04 
 
 
150 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  35.77 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3528  hypothetical protein  31.65 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1206  hypothetical protein  35.09 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3529  hypothetical protein  35.09 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.452767  normal  0.831541 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0712  hypothetical protein  31.55 
 
 
205 aa  67  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0525  hypothetical protein  41.23 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3838  hypothetical protein  33.82 
 
 
163 aa  62.8  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788301  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7429  hypothetical protein  37.17 
 
 
185 aa  59.7  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0751032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2727  hypothetical protein  28.51 
 
 
254 aa  58.9  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492193  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3026  hypothetical protein  28.38 
 
 
252 aa  58.9  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2651  hypothetical protein  30.26 
 
 
253 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598779  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1876  hypothetical protein  31.12 
 
 
253 aa  56.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.184219  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2327  hypothetical protein  30.47 
 
 
265 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1286  hypothetical protein  29.57 
 
 
253 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1514  hypothetical protein  35.66 
 
 
131 aa  55.1  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1252  hypothetical protein  29.65 
 
 
290 aa  55.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0855009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3733  hypothetical protein  32.91 
 
 
256 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199319  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0684  hypothetical protein  32.91 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2618  hypothetical protein  29.78 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109869  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1261  hypothetical protein  31.65 
 
 
265 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7729  hypothetical protein  48.08 
 
 
62 aa  52.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0250143  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3074  hypothetical protein  29.63 
 
 
177 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.426221  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1140  hypothetical protein  32.38 
 
 
261 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2608  hypothetical protein  32.48 
 
 
256 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245764  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2935  hypothetical protein  31.88 
 
 
249 aa  51.6  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0459  hypothetical protein  28.27 
 
 
257 aa  49.7  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.445694  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3560  hypothetical protein  33.82 
 
 
148 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31130  hypothetical protein  32.07 
 
 
256 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514667  unclonable  1.26919e-22 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4164  hypothetical protein  27.16 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36000  hypothetical protein  31.85 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0127  hypothetical protein  33.04 
 
 
149 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488443  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3182  hypothetical protein  44.16 
 
 
167 aa  46.2  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860952  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3815  hypothetical protein  34.75 
 
 
124 aa  46.2  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.757001 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1983  hypothetical protein  30.96 
 
 
272 aa  45.4  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247062  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3067  hypothetical protein  37.5 
 
 
58 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1483  hypothetical protein  42.37 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2796  hypothetical protein  26.13 
 
 
203 aa  43.9  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232161  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1036  hypothetical protein  34.86 
 
 
138 aa  42.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128051  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3365  hypothetical protein  32.74 
 
 
124 aa  42  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828629  normal  0.105235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>