36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1983 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1983  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247062  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3733  hypothetical protein  92.28 
 
 		 256 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199319  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4164  hypothetical protein  69.66 
 
 		 265 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2608  hypothetical protein  89.43 
 
 		 256 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36000  hypothetical protein  84.71 
 
 		 260 aa  364  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0684  hypothetical protein  88.62 
 
 		 256 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31130  hypothetical protein  87.8 
 
 		 256 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514667  unclonable  1.26919e-22 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2327  hypothetical protein  81.27 
 
 		 265 aa  353  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1261  hypothetical protein  71.71 
 
 		 265 aa  324  8.000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1286  hypothetical protein  67.82 
 
 		 253 aa  321  7e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1252  hypothetical protein  67.05 
 
 		 290 aa  320  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0855009 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2651  hypothetical protein  66.67 
 
 		 253 aa  316  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598779  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1876  hypothetical protein  66.67 
 
 		 253 aa  314  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.184219  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3026  hypothetical protein  68.42 
 
 		 252 aa  305  7e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2727  hypothetical protein  68.42 
 
 		 254 aa  305  7e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3528  hypothetical protein  65.13 
 
 		 253 aa  304  8.000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0459  hypothetical protein  64.77 
 
 		 257 aa  294  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.445694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2935  hypothetical protein  65.13 
 
 		 249 aa  293  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1483  hypothetical protein  66.67 
 
 		 263 aa  275  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2618  hypothetical protein  68.98 
 
 		 249 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1140  hypothetical protein  59 
 
 		 261 aa  238  9e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  30.94 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  30.96 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3560  hypothetical protein  43.42 
 
 		 148 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3438  hypothetical protein  22.8 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000158666  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  45.76 
 
 		 173 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0765  hypothetical protein  22.8 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000339675  normal  0.0299181 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3567  hypothetical protein  22.8 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2339  hypothetical protein  40.79 
 
 		 148 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3838  hypothetical protein  50 
 
 		 163 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788301  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  46.03 
 
 		 192 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0712  hypothetical protein  41.07 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3174  hypothetical protein  42.11 
 
 		 150 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1981  hypothetical protein  44.62 
 
 		 273 aa  42.7  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0525  hypothetical protein  47.27 
 
 		 174 aa  42.7  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1036  hypothetical protein  45.31 
 
 		 138 aa  42.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128051  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>