17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0765 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3438  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000158666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3567  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0765  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  509  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000339675  normal  0.0299181 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  23.35 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1252  hypothetical protein  23.31 
 
 
290 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0855009 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2327  hypothetical protein  37.93 
 
 
265 aa  49.3  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4164  hypothetical protein  23.08 
 
 
265 aa  48.9  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1876  hypothetical protein  22.59 
 
 
253 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.184219  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1981  hypothetical protein  30 
 
 
273 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3026  hypothetical protein  22.78 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1286  hypothetical protein  21.61 
 
 
253 aa  44.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2727  hypothetical protein  22.78 
 
 
254 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492193  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2651  hypothetical protein  22.59 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598779  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3174  hypothetical protein  28.44 
 
 
150 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3528  hypothetical protein  21.61 
 
 
253 aa  43.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2618  hypothetical protein  22.46 
 
 
249 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109869  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0459  hypothetical protein  22.88 
 
 
257 aa  42.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.445694  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>