29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1487 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1487  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  424  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  52.88 
 
 		 192 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  50.64 
 
 		 173 aa  141  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3560  hypothetical protein  43.45 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7429  hypothetical protein  50.88 
 
 		 185 aa  99.8  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751032 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2339  hypothetical protein  40.56 
 
 		 148 aa  99  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2866  hypothetical protein  35.86 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.0242431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4017  hypothetical protein  35.12 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0579  hypothetical protein  34.76 
 
 		 185 aa  90.9  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0712  hypothetical protein  34.69 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0761  hypothetical protein  43.93 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1036  hypothetical protein  45.22 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3815  hypothetical protein  45 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.757001 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3838  hypothetical protein  35.1 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788301  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1206  hypothetical protein  38.46 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3529  hypothetical protein  38.46 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.452767  normal  0.831541 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0127  hypothetical protein  31.03 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488443  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3017  hypothetical protein  39.81 
 
 		 177 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3681  hypothetical protein  28.79 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7729  hypothetical protein  48.08 
 
 		 62 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0250143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3365  hypothetical protein  35.34 
 
 		 124 aa  52.8  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828629  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  28.9 
 
 		 248 aa  51.6  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3074  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.426221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0525  hypothetical protein  35.71 
 
 		 174 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2796  hypothetical protein  26.6 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  29.5 
 
 		 261 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3174  hypothetical protein  31.2 
 
 		 150 aa  46.6  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1514  hypothetical protein  36.84 
 
 		 131 aa  45.8  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2626  hypothetical protein  37.61 
 
 		 114 aa  45.1  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>