More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1989 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5237  valyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 		 906 aa  951    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1214  valyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 		 990 aa  638    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.152091  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4237  valyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 		 930 aa  978    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19671  normal  0.989502 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18921  valyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 918 aa  696    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1674  valyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 		 947 aa  1066    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18101  valyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 933 aa  670    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1070  valyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 1242 aa  669    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147885  hitchhiker  0.000000182649 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0705  valyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 909 aa  739    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.727948  normal  0.597989 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4005  valyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 927 aa  712    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.311642 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 909 aa  748    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1436  valyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 952 aa  966    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.571959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 1002 aa  689    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2790  valyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 994 aa  744    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150829  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0678  valyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 909 aa  737    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1989  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 987 aa  2024    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3947  valyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 		 955 aa  975    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2213  valyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 925 aa  719    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198562  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18731  valyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 918 aa  697    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29141  valyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 947 aa  681    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1775  valyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 		 918 aa  693    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.651419  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 909 aa  721    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 882 aa  741    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0699  valyl-tRNA synthetase  99.39 
 
 		 987 aa  2015    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2892  valyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 972 aa  955    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3477  valyl-tRNA synthetase  57.26 
 
 		 1029 aa  1136    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0964875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2570  valyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 952 aa  958    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.252314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1475  valyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 947 aa  1041    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.515714  normal  0.107806 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2579  valyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 		 968 aa  963    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0215604 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1828  valyl-tRNA synthetase  50.05 
 
 		 954 aa  968    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2853  valyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 957 aa  955    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.250427  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1151  valyl-tRNA synthetase  54.14 
 
 		 947 aa  1035    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0456653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1706  valyl-tRNA synthetase  56.24 
 
 		 1031 aa  1137    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.987588 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2683  valyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 947 aa  1065    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18731  valyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 		 918 aa  672    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.122386  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1571  valyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 		 926 aa  998    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1334  valyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 977 aa  754    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 911 aa  726    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2087  valyl-tRNA synthetase  59.91 
 
 		 1037 aa  1207    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3087  valyl-tRNA synthetase  94.32 
 
 		 987 aa  1903    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.705018  normal  0.448197 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 1006 aa  684    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2331  valyl-tRNA synthetase  60.56 
 
 		 1030 aa  1186    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.748917  normal  0.908682 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0110  valyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 991 aa  690    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33832  predicted protein  36.94 
 
 		 1056 aa  630  1e-179  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.828638  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1132  valyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 		 876 aa  613  9.999999999999999e-175  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.860788 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2278  valyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 		 877 aa  611  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2150  valyl-tRNA synthetase  64.02 
 
 		 907 aa  606  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0616063 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0291  valyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 		 890 aa  607  9.999999999999999e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43016  predicted protein  35.41 
 
 		 1066 aa  602  1.0000000000000001e-171  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4095  valyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 		 880 aa  602  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09000  valyl-tRNA synthetase  36.6 
 
 		 888 aa  598  1e-169  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.521853  normal  0.529828 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1417  valyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 		 878 aa  590  1e-167  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0253  valyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 		 904 aa  591  1e-167  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07906  putative valyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 		 876 aa  590  1e-167  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1244  valyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 		 887 aa  592  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5159  valyl-tRNA synthetase  63.86 
 
 		 906 aa  588  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.174874 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4694  valyl-tRNA synthetase  63.64 
 
 		 906 aa  588  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.146741  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01880  valine-tRNA ligase, putative  34.43 
 
 		 1109 aa  582  1e-164  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.332908  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3006  valyl-tRNA synthetase  61.49 
 
 		 909 aa  576  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5430  valyl-tRNA synthetase  63.3 
 
 		 905 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0396856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2435  valyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 		 880 aa  579  1.0000000000000001e-163  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0576  valyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 		 939 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5529  valyl-tRNA synthetase  34.13 
 
 		 895 aa  572  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0965333 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5880  valyl-tRNA synthetase  63.22 
 
 		 903 aa  568  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72245  valyl-tRNA synthetase  35.32 
 
 		 1051 aa  569  1e-160  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6497  valyl-tRNA synthetase  62.31 
 
 		 903 aa  561  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1688  valyl-tRNA synthetase  59.91 
 
 		 902 aa  561  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.524019 
 
 
-
 
NC_004310  BR0948  valyl-tRNA synthetase  60.26 
 
 		 910 aa  558  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0687  valyl-tRNA synthetase  56.99 
 
 		 908 aa  553  1e-156  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000177332  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0654  valyl-tRNA synthetase  56.99 
 
 		 908 aa  553  1e-156  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000423927  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0940  valyl-tRNA synthetase  60.04 
 
 		 910 aa  555  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2241  valyl-tRNA synthetase  59.61 
 
 		 910 aa  550  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1723  valyl-tRNA synthetase  59.78 
 
 		 912 aa  542  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.419395  hitchhiker  0.00814152 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  55.6 
 
 		 893 aa  512  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1783  valyl-tRNA synthetase  56.67 
 
 		 891 aa  509  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15043  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2144  valyl-tRNA synthetase  55.73 
 
 		 920 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2069  valyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 998 aa  509  9.999999999999999e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1377  valyl-tRNA synthetase  55.65 
 
 		 952 aa  504  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0386  valyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 		 951 aa  499  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0442  valyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 		 951 aa  502  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3559  valyl-tRNA synthetase  55.07 
 
 		 951 aa  499  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0790  valyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 953 aa  502  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0560  valyl-tRNA synthetase  53.81 
 
 		 958 aa  499  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.16607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3545  valyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 		 965 aa  498  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.562165  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4045  valyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 		 965 aa  498  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.230085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3681  valyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 		 965 aa  498  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.470005  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4880  valyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 		 951 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3722  valyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 		 951 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12918  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1503  valyl-tRNA synthetase  53.02 
 
 		 924 aa  493  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000330515  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1796  valyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 		 879 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03637  valyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 952 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0091  valyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 943 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2085  valyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 		 953 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000735472  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0484  valyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 		 925 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.762053 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3530  valyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 		 943 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723438  normal  0.0830498 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0738  valyl-tRNA synthetase  53.96 
 
 		 973 aa  491  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4861  valyl-tRNA synthetase  52.14 
 
 		 951 aa  493  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.522647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4824  valyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 951 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01578  valyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 		 924 aa  491  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.337374  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1092  valyl-tRNA synthetase  54.35 
 
 		 896 aa  491  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.75364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0959  valyl-tRNA synthetase  53.52 
 
 		 950 aa  489  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>