More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0576 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01578  valyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 924 aa  671    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.337374  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 881 aa  670    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0576  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 939 aa  1947    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 880 aa  657    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2045  valyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 887 aa  673    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3681  valyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 		 965 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.470005  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1364  valyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 909 aa  649    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3264  valyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 		 958 aa  650    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.205067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1531  valyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 888 aa  690    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 879 aa  669    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 881 aa  647    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 881 aa  647    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2896  valyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 		 976 aa  645    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.588712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0010  valyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 		 922 aa  723    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.885408  hitchhiker  0.00234532 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3424  valyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 958 aa  656    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2742  valyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 		 958 aa  649    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.829752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 881 aa  647    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 881 aa  646    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 881 aa  646    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 892 aa  672    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0785  valyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 921 aa  665    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0756  valyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 921 aa  664    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  37.81 
 
 		 880 aa  650    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1255  valyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 		 958 aa  648    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0428359  hitchhiker  0.0000057617 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3085  valyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 943 aa  644    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405108 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1281  valyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 		 933 aa  648    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.202707  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21513  predicted protein  37.66 
 
 		 1035 aa  637    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275387  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0577  valyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 		 912 aa  656    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3169  valyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 		 979 aa  640    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.235624 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 881 aa  647    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4880  valyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 		 951 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1721  valyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 876 aa  636    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 885 aa  687    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4731  valyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 		 951 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.342203 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0684  valyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 917 aa  643    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.980667  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 866 aa  660    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 884 aa  648    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1755  valyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 876 aa  636    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.746599  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0956  valyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 887 aa  662    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2839  valyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 		 883 aa  698    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1503  valyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 		 924 aa  673    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000330515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 881 aa  647    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2178  valyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 		 976 aa  637    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 865 aa  694    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 909 aa  671    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 867 aa  674    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 879 aa  683    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 880 aa  682    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 		 881 aa  643    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0678  valyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 909 aa  660    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 		 885 aa  651    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 		 881 aa  644    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1369  valyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 		 922 aa  647    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1799  valyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 886 aa  683    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.398016  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2073  valyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 888 aa  645    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3721  valyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 		 973 aa  645    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0971795  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 881 aa  696    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2867  valyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 		 968 aa  643    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1729  valyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 884 aa  666    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 909 aa  674    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3563  valyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 883 aa  638    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2138  valyl-tRNA synthetase  36.65 
 
 		 984 aa  637    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.571055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0923  valyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 959 aa  638    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4824  valyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 951 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 865 aa  687    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2238  valyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 884 aa  644    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.180056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12474  valyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 876 aa  658    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3558  valyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 883 aa  637    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462597  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3564  valyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 921 aa  641    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3112  valyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 		 958 aa  646    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0139343  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 874 aa  679    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 880 aa  651    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 880 aa  650    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1259  valyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 948 aa  646    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4861  valyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 		 951 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.522647 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1130  valyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 958 aa  653    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00231601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1201  valyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 958 aa  652    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.418789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0555  valyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 917 aa  660    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0916  valyl-tRNA synthetase  36 
 
 		 968 aa  637    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.276486  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 		 883 aa  642    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3121  valyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 958 aa  644    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000565477  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0504  valyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 		 884 aa  652    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000238585  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0367  valyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 907 aa  696    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.159173  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2479  valyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 		 880 aa  639    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225877  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 881 aa  647    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2630  valyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 900 aa  636    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21531  valyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 933 aa  646    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0606355  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3545  valyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 		 965 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.562165  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 		 881 aa  648    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0192  valyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 892 aa  689    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.209132  normal  0.584595 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1474  valyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 929 aa  656    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0304029  normal  0.195737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1131  valyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 958 aa  654    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00349082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0129  valyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 904 aa  680    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2538  valyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 897 aa  689    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1580  valyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 886 aa  686    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0790  valyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 		 953 aa  660    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3631  valyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 883 aa  637    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0657894 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4045  valyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 		 965 aa  639    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.230085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3951  valyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 		 897 aa  657    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2765  valyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 883 aa  673    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.700056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>