More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1417 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 881 aa  689    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 909 aa  670    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2538  valyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 897 aa  679    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2045  valyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 887 aa  653    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 892 aa  734    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1132  valyl-tRNA synthetase  60.98 
 
 		 876 aa  1137    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.860788 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2685  valyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 888 aa  690    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000391784 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 876 aa  709    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2097  valyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 921 aa  648    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.694852  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1531  valyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 888 aa  687    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 881 aa  714    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 865 aa  674    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 883 aa  692    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1799  valyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 886 aa  698    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.398016  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2144  valyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 920 aa  664    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1721  valyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 876 aa  709    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 881 aa  711    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 881 aa  711    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2381  valyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 903 aa  701    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 881 aa  713    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0406  valyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 904 aa  700    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0785  valyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 921 aa  652    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0756  valyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 		 921 aa  650    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 882 aa  714    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 881 aa  714    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3085  valyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 943 aa  644    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405108 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2073  valyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 888 aa  638    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 883 aa  740    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0577  valyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 912 aa  638    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1436  valyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 952 aa  636    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.571959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 		 1002 aa  642    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 881 aa  711    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1091  valyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 929 aa  648    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 885 aa  685    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1755  valyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 876 aa  709    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.746599  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 885 aa  687    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42662  predicted protein  39.32 
 
 		 924 aa  644    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0386  valyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 901 aa  718    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.673451 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01578  valyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 924 aa  658    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.337374  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0388  valyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 		 902 aa  746    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.427268  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 881 aa  713    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0956  valyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 887 aa  671    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2839  valyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 883 aa  655    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1503  valyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 924 aa  653    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000330515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 881 aa  711    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1475  valyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 947 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.515714  normal  0.107806 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 909 aa  663    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1674  valyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 947 aa  646    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0504  valyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 884 aa  694    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000238585  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1796  valyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 		 879 aa  638    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 880 aa  684    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2278  valyl-tRNA synthetase  71.69 
 
 		 877 aa  1370    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3530  valyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 943 aa  636    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723438  normal  0.0830498 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 865 aa  682    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3947  valyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 955 aa  659    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1369  valyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 922 aa  640    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2570  valyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 952 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.252314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0091  valyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 943 aa  644    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1729  valyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 884 aa  666    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 881 aa  720    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 881 aa  715    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2006  valyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 910 aa  670    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2634 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1828  valyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 954 aa  643    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 880 aa  737    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 879 aa  702    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0678  valyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 909 aa  644    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1256  valyl-tRNA synthetase  56.41 
 
 		 877 aa  1046    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 879 aa  721    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0291  valyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 890 aa  686    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3564  valyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 921 aa  670    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1571  valyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 926 aa  637    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2435  valyl-tRNA synthetase  60.2 
 
 		 880 aa  1134    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 880 aa  723    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 880 aa  719    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 881 aa  712    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 911 aa  639    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 866 aa  686    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 867 aa  667    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0555  valyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 917 aa  669    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036551 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2036  valyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 918 aa  714    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.895366 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 883 aa  701    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2765  valyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 883 aa  659    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.700056 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 874 aa  659    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 874 aa  748    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2479  valyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 880 aa  706    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225877  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1392  valyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 902 aa  693    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0390871  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1219  valyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 		 879 aa  662    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 894 aa  695    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 883 aa  698    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0684  valyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 917 aa  663    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.980667  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0192  valyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 892 aa  670    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.209132  normal  0.584595 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1474  valyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 929 aa  639    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0304029  normal  0.195737 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 881 aa  695    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1580  valyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 886 aa  695    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2029  valyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 904 aa  721    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0790  valyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 953 aa  639    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 881 aa  662    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2238  valyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 884 aa  642    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.180056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 884 aa  739    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1836  valyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 902 aa  712    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.66816  normal  0.802298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>