More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2331 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2853  valyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 957 aa  830    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.250427  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3087  valyl-tRNA synthetase  60.67 
 
 		 987 aa  1205    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.705018  normal  0.448197 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5159  valyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 		 906 aa  870    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.174874 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1591  valyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 		 957 aa  648    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2178  valyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 		 976 aa  648    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0785  valyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 		 921 aa  657    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0756  valyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 		 921 aa  657    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1419  valyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 		 955 aa  640    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1850  valyl-tRNA synthetase  36.35 
 
 		 984 aa  651    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.546477  normal  0.957317 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1674  valyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 947 aa  912    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1436  valyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 952 aa  832    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.571959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1989  valyl-tRNA synthetase  60.79 
 
 		 987 aa  1211    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1151  valyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 947 aa  923    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0456653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4585  valyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 		 955 aa  642    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2213  valyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 925 aa  644    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198562  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0699  valyl-tRNA synthetase  60.79 
 
 		 987 aa  1209    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 		 909 aa  657    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1334  valyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 977 aa  698    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5237  valyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 906 aa  864    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2633  valyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 		 955 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3477  valyl-tRNA synthetase  63.13 
 
 		 1029 aa  1269    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0964875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2087  valyl-tRNA synthetase  61.45 
 
 		 1037 aa  1248    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1828  valyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 954 aa  833    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2138  valyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 		 984 aa  656    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.571055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3722  valyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 951 aa  677    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12918  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1706  valyl-tRNA synthetase  61.92 
 
 		 1031 aa  1264    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.987588 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0684  valyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 917 aa  689    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.980667  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2790  valyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 994 aa  645    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150829  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1571  valyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 926 aa  887    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 		 909 aa  676    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1475  valyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 947 aa  908    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.515714  normal  0.107806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 911 aa  677    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2683  valyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 947 aa  913    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4694  valyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 906 aa  869    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.146741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4237  valyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 930 aa  871    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19671  normal  0.989502 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0705  valyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 		 909 aa  659    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.727948  normal  0.597989 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4005  valyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 927 aa  683    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.311642 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2331  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 1030 aa  2098    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.748917  normal  0.908682 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0393  valyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 		 952 aa  667    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0110  valyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 991 aa  664    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0959  valyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 950 aa  698    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3947  valyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 955 aa  823    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1691  valyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 955 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0422  valyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 955 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0927  valyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 955 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1846  valyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 955 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1669  valyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 955 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1460  valyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 955 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0741  valyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 955 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1874  valyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 955 aa  627  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0384626 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 		 1002 aa  626  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0678  valyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 		 909 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18101  valyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 933 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1716  valyl-tRNA synthetase  35.99 
 
 		 963 aa  622  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.894816  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18921  valyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 		 918 aa  624  1e-177  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18731  valyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 		 918 aa  625  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1281  valyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 		 933 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.202707  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1775  valyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 		 918 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.651419  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21531  valyl-tRNA synthetase  36.6 
 
 		 933 aa  621  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0606355  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29141  valyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 		 947 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18731  valyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 		 918 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.122386  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 1006 aa  613  9.999999999999999e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1214  valyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 		 990 aa  607  9.999999999999999e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.152091  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1070  valyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 1242 aa  605  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147885  hitchhiker  0.000000182649 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 		 891 aa  602  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0236  valyl-tRNA synthetase  33.53 
 
 		 879 aa  569  1e-160  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0253  valyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 		 904 aa  560  1e-158  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1244  valyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 887 aa  552  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1132  valyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 		 876 aa  546  1e-154  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.860788 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72245  valyl-tRNA synthetase  34.08 
 
 		 1051 aa  545  1e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2278  valyl-tRNA synthetase  33.53 
 
 		 877 aa  538  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4095  valyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 880 aa  535  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01880  valine-tRNA ligase, putative  32.79 
 
 		 1109 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.332908  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33832  predicted protein  33.09 
 
 		 1056 aa  516  1e-144  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.828638  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10195  valyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_8G04800)  31.96 
 
 		 1033 aa  500  1e-140  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5430  valyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 		 905 aa  502  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0396856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5880  valyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 		 903 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1688  valyl-tRNA synthetase  51.38 
 
 		 902 aa  492  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.524019 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43016  predicted protein  32.4 
 
 		 1066 aa  492  1e-137  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2892  valyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 972 aa  492  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2570  valyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 952 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.252314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6497  valyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 903 aa  493  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3006  valyl-tRNA synthetase  50.99 
 
 		 909 aa  490  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2579  valyl-tRNA synthetase  52.27 
 
 		 968 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0215604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2150  valyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 907 aa  485  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0616063 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1723  valyl-tRNA synthetase  51.39 
 
 		 912 aa  481  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.419395  hitchhiker  0.00814152 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 893 aa  482  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0948  valyl-tRNA synthetase  52.18 
 
 		 910 aa  476  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2241  valyl-tRNA synthetase  52.18 
 
 		 910 aa  479  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0654  valyl-tRNA synthetase  49.11 
 
 		 908 aa  474  1e-132  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000423927  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0687  valyl-tRNA synthetase  49.11 
 
 		 908 aa  474  1e-132  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000177332  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0940  valyl-tRNA synthetase  51.98 
 
 		 910 aa  473  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0790  valyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 953 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2846  valyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 904 aa  461  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.292827  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1008  valyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 971 aa  458  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0987932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1059  valyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 966 aa  458  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1201  valyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 958 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.418789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1131  valyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 958 aa  457  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00349082  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3424  valyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 		 958 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0901  valyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 		 971 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>