62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0575 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0575  prevent-host-death protein  100 
 
 		 80 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103149  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1710  prevent-host-death protein  50 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0140  prevent-host-death family protein  48.1 
 
 		 83 aa  68.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3527  prevent-host-death family protein  48.81 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378115  normal  0.865399 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3378  prevent-host-death family protein  48.1 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185106  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5883  prevent-host-death family protein  45.45 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.635627 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0090  prevent-host-death protein  48.15 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3078  prevent-host-death protein  43.21 
 
 		 80 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.018345  normal  0.547068 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3345  prevent-host-death protein  41.98 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.408445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2340  prevent-host-death family protein  35.37 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4105  hypothetical protein  41.25 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  48 
 
 		 93 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  36.14 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  36.14 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2469  prevent-host-death family protein  51.11 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117875  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  38.46 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2929  prevent-host-death family protein  58.54 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.106644 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4537  prevent-host-death family protein  46.67 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0623765 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5263  prevent-host-death family protein  41.46 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2347  antitoxin of a toxin/antitoxin system, phd-like protein  37.14 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4580  prevent-host-death family protein  41.89 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2085  prevent-host-death family protein  35.37 
 
 		 86 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3677  prevent-host-death family protein  40 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763489  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0046  prevent-host-death family protein  45.45 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.41963  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0623  prevent-host-death protein  39.02 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0024  prevent-host-death protein  45.45 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3930  Axe family addiction module antitoxin  45.1 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2530  prevent-host-death protein  43.33 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0065  prevent-host-death family protein  45.45 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2645  prevent-host-death family protein  48.98 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4285  hypothetical protein  40.54 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192464  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0775  prevent-host-death protein  38.57 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99719  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3421  prevent-host-death family protein  39.74 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.985918 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1595  prevent-host-death family protein  46.15 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  37.68 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1315  prevent-host-death family protein  55.56 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147155  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4538  prevent-host-death family protein  40.58 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3828  addiction module antitoxin  43.14 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.899294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4019  prevent-host-death family protein  41.54 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1318  prevent-host-death family protein  47.83 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.404403  normal  0.571647 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4693  prevent-host-death family protein  32.86 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.490167 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2918  prevent-host-death family protein  34.62 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0546  prevent-host-death family protein  44.07 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241821  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1697  prevent-host-death family protein  46.15 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000276102  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4551  prevent-host-death family protein  51.22 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0238  prevent-host-death family protein  53.49 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.030686  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1066  prevent-host-death family protein  53.85 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2038  prevent-host-death family protein  34.67 
 
 		 85 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3164  prevent-host-death family protein  42.42 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.332735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00630  Prevent-host-death protein  43.4 
 
 		 76 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000263999  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5092  prevent-host-death family protein  42.62 
 
 		 112 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3369  prevent-host-death family protein  44.23 
 
 		 86 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0934085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3587  prevent-host-death family protein  51.16 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550844  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0872  hypothetical protein  40.98 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.653193  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0856  prevent-host-death protein  37.5 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162182 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0735  prevent-host-death family protein  34.94 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4711  prevent-host-death family protein  36.9 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2983  prevent-host-death family protein  58.97 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.413921  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3886  prevent-host-death family protein  51.28 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2596  prevent-host-death family protein  58.97 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0061  prevent-host-death family protein  47.73 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933415  normal  0.536193 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0994  prevent-host-death protein  45.45 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>