58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4693 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4693  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 80 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.490167 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2423  prevent-host-death protein  70.67 
 
 		 82 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2347  antitoxin of a toxin/antitoxin system, phd-like protein  57.69 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3677  prevent-host-death family protein  62.34 
 
 		 81 aa  101  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763489  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2530  prevent-host-death family protein  62.34 
 
 		 80 aa  98.2  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0024  prevent-host-death protein  61.54 
 
 		 82 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0065  prevent-host-death family protein  61.54 
 
 		 82 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0046  prevent-host-death family protein  61.54 
 
 		 82 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.41963  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0994  prevent-host-death protein  55.84 
 
 		 82 aa  97.1  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938968 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2184  prevent-host-death family protein  55.84 
 
 		 85 aa  94  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.415142  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0788  prevent-host-death family protein  51.28 
 
 		 95 aa  88.2  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424176  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4538  prevent-host-death family protein  51.95 
 
 		 82 aa  87  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0775  prevent-host-death protein  50.65 
 
 		 79 aa  85.9  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99719  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  50 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  44 
 
 		 76 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1429  prevent-host-death family protein  48.48 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1037  prevent-host-death family protein  45.95 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2456  prevent-host-death family protein  40.26 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2599  prevent-host-death family protein  45.45 
 
 		 84 aa  61.6  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143583  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31860  Prevent-host-death family protein  43.28 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0199  prevent-host-death family protein  39.51 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.172056  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00630  Prevent-host-death protein  41.33 
 
 		 76 aa  57  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000263999  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  41.94 
 
 		 73 aa  57  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2910  prevent-host-death family protein  43.59 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.293709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3368  prevent-host-death family protein  35.53 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2443  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0810105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0206  prevent-host-death family protein  45.76 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581637  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1572  prevent host death protein  38.36 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677398  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0414  prevent host death protein  39.71 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0577  prevent-host-death family protein  39.71 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3329  prevent-host-death family protein  37.66 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5349  prevent-host-death family protein  52.27 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3738  prevent-host-death family protein  54.55 
 
 		 77 aa  51.6  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1455  prevent-host-death family protein  40.91 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4019  prevent-host-death family protein  36.71 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3716  prevent-host-death family protein  55.26 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3631  prevent-host-death family protein  36.07 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1573  prevent-host-death family protein  40.62 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6300  hypothetical protein  32.84 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0266  prevent-host-death family protein  38.1 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000350638  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0108  prevent-host-death family protein  43.9 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4124  prevent-host-death family protein  40.62 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.167501  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1433  prevent-host-death protein  32.88 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.205341  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4434  prevent-host-death protein  28.95 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0804206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1186  prevent-host-death family protein  41.46 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0748873  normal  0.669167 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3504  hypothetical protein  36.36 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000315772  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1204  prevent-host-death protein  34 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2969  prevent-host-death family protein  29.11 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686519 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1406  prevent-host-death family protein  34.67 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2948  prevent-host-death family protein  28.75 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183383  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2334  prevent-host-death protein  28.75 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21073  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4044  prevent-host-death protein  29.69 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.104043  normal  0.215101 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5378  prevent-host-death family protein  34.92 
 
 		 64 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.963401 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1816  prevent-host-death family protein  40.48 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00000021208  hitchhiker  0.0000000000223341 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2637  prevent-host-death protein  45.45 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0707  prevent-host-death family protein  32.53 
 
 		 89 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1777  prevent-host-death family protein  42.22 
 
 		 83 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1948  prevent-host-death family protein  42.5 
 
 		 78 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.861466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>